Dynamics of genetic variation in <i>Taxus baccata</i>: local versus regional perspectives
Notice bibliographique
Résumé
Increasing loss of habitat tends to reduce biodiversity at the inter- and intra-specific levels. Within species, the remaining diversity is often partitioned so that a great amount of neutral genetic variation is assigned to among-population variation. This implies reduced gene flow as a consequence of population isolation. We tested whether random amplified polymorphic DNA (RAPD) markers indicate population and (or) regional differentiation in Swiss populations of English yew (Taxus baccata L.), a dioecious forest tree species with scattered distribution. Our sampling included three northern Swiss regions, each containing four populations, and a central-Alpine region with two populations. Four RAPD primers, giving rise to 41 scorable marker bands, identified all but two sampled individuals as unique genotypes. Analyses of molecular variance (AMOVA) detected no significant differentiation among the three northern Swiss regions yet a marginally significant differentiation of these regions versus the central-Alpine region. Concordantly, Mantel tests revealed isolation by distance only when considering all 14 populations. We postulate that the inferred level of gene flow, through wind-borne pollen and occasional long-distance seed dispersal, prevents isolation by distance in northern Switzerland, where stands of T. baccata are relatively abundant. This perpetuates a coherent regional network of occurrences of T. baccata, as might be expected in a metapopulation.Key words: genetic variation, isolation by distance, metapopulation, population differentiation, RAPD-PCR, Taxus baccata.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».