MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2125837327 · doi:10.1139/b03-136

Dynamics of genetic variation in <i>Taxus baccata</i>: local versus regional perspectives

2004· article· en· W2125837327 sur OpenAlexvenueno aff
Karin Hilfiker, Rolf Holderegger, Peter Rotach, Félix Gugerli

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Botany · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesEidgenössische Technische Hochschule Zürich
Mots-clésMetapopulationBiologyBiological dispersalGene flowTaxusPopulationIsolation by distanceEcologyGenetic diversityGenetic variationRAPDAnalysis of molecular varianceMantel testPicea abiesGeographical distanceBotanyGeneticsDemographyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Increasing loss of habitat tends to reduce biodiversity at the inter- and intra-specific levels. Within species, the remaining diversity is often partitioned so that a great amount of neutral genetic variation is assigned to among-population variation. This implies reduced gene flow as a consequence of population isolation. We tested whether random amplified polymorphic DNA (RAPD) markers indicate population and (or) regional differentiation in Swiss populations of English yew (Taxus baccata L.), a dioecious forest tree species with scattered distribution. Our sampling included three northern Swiss regions, each containing four populations, and a central-Alpine region with two populations. Four RAPD primers, giving rise to 41 scorable marker bands, identified all but two sampled individuals as unique genotypes. Analyses of molecular variance (AMOVA) detected no significant differentiation among the three northern Swiss regions yet a marginally significant differentiation of these regions versus the central-Alpine region. Concordantly, Mantel tests revealed isolation by distance only when considering all 14 populations. We postulate that the inferred level of gene flow, through wind-borne pollen and occasional long-distance seed dispersal, prevents isolation by distance in northern Switzerland, where stands of T. baccata are relatively abundant. This perpetuates a coherent regional network of occurrences of T. baccata, as might be expected in a metapopulation.Key words: genetic variation, isolation by distance, metapopulation, population differentiation, RAPD-PCR, Taxus baccata.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,723
Score d'incertitude au seuil0,971

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,210
Écart entre enseignants0,201 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations47
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCanadian Journal of BotanyMême sujetGenetic diversity and population structureTravaux en français237 207