MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2125955619 · doi:10.1158/1078-0432.ccr-13-0606

<i>PIK3CA, BRAF</i>, and PTEN Status and Benefit from Cetuximab in the Treatment of Advanced Colorectal Cancer—Results from NCIC CTG/AGITG CO.17

2013· article· en· W2125955619 sur OpenAlexaff
Christos S. Karapetis, Derek J. Jonker, Manijeh Daneshmand, Jennifer Hanson, Christopher J. O’Callaghan, Celia Marginean, John Zalcberg, John Simes, Malcolm J. Moore, Niall C. Tebbutt, Timothy Price, Jeremy Shapiro, Nick Pavlakis, Peter Gibbs, Guy A. Van Hazel, Ursula Lee, Rashida Haq, Shakeel Virk, Dongsheng Tu, Ian A.J. Lorimer

Notice bibliographique

RevueClinical Cancer Research · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueColorectal Cancer Treatments and Studies
Établissements canadiensOttawa Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPTENCetuximabColorectal cancerMedicineOncologyInternal medicineBiomarkerImmunohistochemistryCancerTissue microarrayCancer researchBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: Cetuximab improves survival in patients with K-ras wild-type advanced colorectal cancer. We examined the predictive and prognostic significance of additional biomarkers in this setting, in particular BRAF, PIK3CA, and PTEN. EXPERIMENTAL DESIGN: Available colorectal tumor samples were analyzed from the CO.17 study. BRAF mutations were identified in tumor-derived DNA by direct sequencing and PIK3CA mutations were identified using a high-resolution melting screen with confirmation by sequencing. PTEN expression by immunohistochemistry (IHC) was performed on tissue microarrays. For each biomarker, prognostic and predictive effects were examined using a Cox model with tests for treatment-biomarker interaction. RESULTS: A total of 572 patients with pretreated colorectal cancer were randomly assigned to receive cetuximab or best supportive care (BSC). Of 401 patients assessed for BRAF status, 13 (3.2%) had mutations. Of 407 patients assessed for PIK3CA status, 61 (15%) had mutations. Of 205 patients assessed for PTEN, 148 (72%) were negative for IHC expression. None of BRAF, PIK3CA, or PTEN was prognostic for overall or progression-free survival in the BSC arm. None was predictive of benefit from cetuximab, either in the whole study population or the K-ras wild-type subset. In the K-ras wild-type subgroup, the overall survival adjusted HR according to BRAF mutation status was 1.39 (interaction P = 0.69), PIK3CA mutation status HR = 0.79 (interaction P = 0.63), and PTEN expression HR = 0.75 (interaction P = 0.61). CONCLUSIONS: In chemotherapy-refractory colorectal cancer, neither PIK3CA mutation status nor PTEN expression were prognostic, nor were they predictive of benefit from cetuximab. Evaluation of predictive significance of BRAF mutations requires a larger sample size.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,131
Tête enseignante GPT0,480
Écart entre enseignants0,349 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations165
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueClinical Cancer ResearchMême sujetColorectal Cancer Treatments and StudiesTravaux en français237 207