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Enregistrement W2126058914 · doi:10.1677/jme-07-0114

Estrogen receptor-related receptor α (ERRα) regulates osteopontin expression through a non-canonical ERRα response element in a cell context-dependent manner

2007· article· en· W2126058914 sur OpenAlexafffund
Ralph Zirngibl, Janet S. M. Chan, Jane E. Aubin

Notice bibliographique

RevueJournal of Molecular Endocrinology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEstrogen and related hormone effects
Établissements canadiensCanada Research ChairsUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Arthritis NetworkInstitute of Musculoskeletal Health and ArthritisCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of TorontoArthritis Society
Mots-clésCell biologyMolecular biologyNFATChemistryRepressorContext (archaeology)BiologyTranscription factorGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We previously demonstrated that the orphan nuclear receptor, estrogen receptor-related receptor alpha (ERRalpha) is highly expressed in osteoblasts and osteoclasts, regulates osteogenesis and expression of osteoblast-associated markers in the rat calvaria cell differentiation system, and is dysregulated in the rat ovariectomy model of postmenopausal osteoporosis. There are conflicting published data on the transcriptional regulation by ERRalpha of the gene for osteopontin (OPN), an extracellular matrix protein required in bone remodeling, and a potential direct target mediating ERRalpha effects in bone. We therefore readdressed OPN gene regulation by ERRalpha in both osteoblastic (rat osteosarcoma ROS17/2.8 cells) and non-osteoblastic (HeLa) cell lines using a mouse proximal 2 kb OPN promoter fragment. A minimal OPN promoter fragment spanning from -56 to +9 bp is activated in HeLa cells but repressed it in ROS17/2.8 cells. Adenine scanning mutagenesis revealed the presence of a non-canonical ERRalpha response element in this minimal promoter. Surprisingly, prototypical inactivating mutations in the activation function 2 (AF2) domain or a naturally occurring allelic variant of ERRalpha (ERRalphaH408) were all better activators than wild-type ERRalpha in HeLa cells, activities that were generally paralleled by repression in ROS17/2.8 cells. Finally, we found that the N-terminus of ERRalpha harbors a repressor domain that acts in a cell context-dependent manner. We conclude that OPN is an ERRalpha target gene whose promoter is regulated by ERRalpha in a cell context-dependent manner and that a predicted silencing mutation in AF2 or a more flexible helix 12 increases ERRalpha transcriptional activity, effects with implications for ERRalpha as a therapeutic target in bone.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,029
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations47
Publié2007
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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