Patient safety without borders: measuring the global burden of adverse events
Notice bibliographique
Résumé
Summary PIWI-interacting (pi)RNA pathways control transposable elements (TEs) and endogenous genes in animal gonads, playing important roles in gamete formation. Here, we report a mechanism by which endogenous protein-coding regions, that normally provide their sequences for translation, serve as origins of non-coding piRNA biogenesis in Drosophila melanogaster testes. The products, namely endo-piRNAs, formed silencing complexes with Aubergine (Aub) in germ cells. Proximity proteome combined to functional analyses revealed a testis-specialized chaperone, Cyclophilin 40 (Cyp40), selectively increases endo-piRNA occupancy inside Aub-RISCs aside from other TE-related piRNAs. Moreover, Argonaute 2 (Ago2) activities were found critical for endo-piRNA production. We provide evidence that Ago2-bound short interfering (si)RNAs and micro(mi)RNAs specify precursors and direct endo-piRNA biogenesis. Consistently, Aub and Ago2 cooperate in spermatid differentiation and regulate endogenous genes via endo-piRNA-directed mRNA cleavage. Collectively, our data highlight that Drosophila testes employ a unique strategy to expand the diversity of germline piRNAs supporting late spermatogenesis. Headlines Endogenous protein-coding regions derive non-coding endo-piRNAs endo-piRNA and TE-piRNA are produced via distinct mechanisms siRNA and miRNA activities direct secondary piRNA biogenesis endo-piRNA pathway controls chromatin and sperm formation
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,009 | 0,026 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».