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Enregistrement W2126193100 · doi:10.1016/j.crohns.2014.01.020

Microbial composition analysis of<i>Clostridium difficile</i>infections in an ulcerative colitis patient treated with multiple fecal microbiota transplantations

2014· review· en· W2126193100 sur OpenAlexafffund
Chantalle Brace, Gregory B. Gloor, Mark J. Ropeleski, Emma Allen‐Vercoe, Elaine O. Petrof

Notice bibliographique

RevueJournal of Crohn s and Colitis · 2014
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueClostridium difficile and Clostridium perfringens research
Établissements canadiensUniversity of GuelphQueen's University
Organismes subventionnairesSoutheastern Ontario Academic Medical OrganizationQueen's UniversityPhysicians' Services Incorporated FoundationCrohn's and Colitis Foundation of Canada
Mots-clésMedicineClostridium difficileFecal bacteriotherapyUlcerative colitisInflammatory bowel diseaseMicrobiomeFecesPopulationInternal medicineGastroenterologyDiseaseAntibioticsMicrobiologyBioinformaticsBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Fecal microbiota transplantation (FMT) is a promising therapy for Clostridium difficile infection (CDI). However, questions remain regarding efficacy and safety in inflammatory bowel disease (IBD) patients, as well as longitudinal stability of donor stool composition. This report describes an IBD patient with two CDIs 18 months apart, each successfully treated with FMT with no IBD flares or complications. Microbiome composition analysis of patient samples during each infection revealed low-diversity microbiota patterns similar to those previously described in non-IBD patients with CDI and active IBD alone. Samples taken after each transplant demonstrated quick remodeling towards the donor's sample composition coinciding with symptom resolution. Of note, samples taken from the same donor 18 months apart reflected marked differences in microbiota abundances, suggesting that the use of single donors in FMT programs offers little benefit in ensuring predictability of donor stool composition over time. This report describes similar microbial composition patterns during CDI in IBD patients to those described previously in non-IBD patients, and supports FMT as safe and effective treatment for recurring CDI in this patient population.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,839
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,001
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,309
Écart entre enseignants0,287 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeAutre devis
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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