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Enregistrement W2126194508 · doi:10.18632/oncotarget.4746

A core of kinase-regulated interactomes defines the neoplastic MDSC lineage

2015· article· en· W2126194508 sur OpenAlex
María Gato, Xabier Martínez de Morentin, Idoia Blanco‐Luquin, Joaquín Fernández‐Irigoyen, Isabel Zudaire, Thérèse Liechtenstein, Hugo Arasanz, Teresa Lozano, Noëlia Casares, A. Chaikuad, Stefan Knapp, David Guerrero‐Setas, David Escors, Grazyna Kochan, Enrique Santamaría

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueOncotarget · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune cells in cancer
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesInstituto de Salud Carlos IIIGobierno de NavarraEusko JaurlaritzaBerrikuntza + Ikerketa + Osasuna Eusko FundazioaWellcome Trust
Mots-clésKinaseCancer researchMAPK/ERK pathwayMyeloid-derived Suppressor CellMyeloidProtein kinase BPI3K/AKT/mTOR pathwayBiologyCancerImmunologyCell biologySignal transductionSuppressorGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

// Maria Gato-Cañas 1, 2, * , Xabier Martinez de Morentin 3, * , Idoia Blanco-Luquin 1, 2, * , Joaquin Fernandez-Irigoyen 3, * , Isabel Zudaire 1 , Therese Liechtenstein 1, 2 , Hugo Arasanz 1, 4 , Teresa Lozano 5 , Noelia Casares 5 , Apirat Chaikuad 6 , Stefan Knapp 6, 7 , David Guerrero-Setas 8 , David Escors 1, 2 , Grazyna Kochan 9 , Enrique Santamaría 3 1 Immunomodulation group, Navarrabiomed-FMS, IdiSNA, Pamplona, Spain 2 Immunomodulation group, Division of Infection and Immunity, University College London, UK 3 Proteomics Unit, Navarrabiomed-FMS, Proteored-ISCIII IdiSNA, Pamplona, Spain 4 Hospital de Navarra, Department of Oncology, IdiSNA, Pamplona, Spain 5 Immunology and Immunotherapy Program, Center for Applied Medical Research, University of Navarra, IdiSNA, Pamplona, Spain 6 Structural Genomics Consortium (SGC), University of Oxford, Headington, UK 7 Institute for Pharmaceutical Chemistry, Johann Wolfgang Goethe-University, Frankfurt, Germany 8 Cancer Epigenetics group, Navarrabiomed-FMS, IdiSNA, Pamplona, Spain 9 Protein Production Unit, Navarrabiomed-FMS, IdiSNA, Pamplona, Spain * These authors have contributed equally to this work Correspondence to: David Escors, e-mail: descorsm@navarra.es Grazyna Kochan, e-mail: grazyna.kochan@navarra.es Enrique Santamaría, e-mail: esantamma@navarra.es Keywords: MDSC, proteomics, interactomes, kinases, therapeutic targets Received: May 25, 2015      Accepted: July 13, 2015      Published: July 23, 2015 ABSTRACT Myeloid-derived suppressor cells (MDSCs) differentiate from bone marrow precursors, expand in cancer-bearing hosts and accelerate tumor progression. MDSCs have become attractive therapeutic targets, as their elimination strongly enhances anti-neoplastic treatments. Here, immature myeloid dendritic cells (DCs), MDSCs modeling tumor-infiltrating subsets or modeling non-cancerous (NC)-MDSCs were compared by in-depth quantitative proteomics. We found that neoplastic MDSCs differentially expressed a core of kinases which controlled lineage-specific (PI3K-AKT and SRC kinases) and cancer-induced (ERK and PKC kinases) protein interaction networks (interactomes). These kinases contributed to some extent to myeloid differentiation. However, only AKT and ERK specifically drove MDSC differentiation from myeloid precursors. Interfering with AKT and ERK with selective small molecule inhibitors or shRNAs selectively hampered MDSC differentiation and viability. Thus, we provide compelling evidence that MDSCs constitute a distinct myeloid lineage distinguished by a “kinase signature” and well-defined interactomes. Our results define new opportunities for the development of anti-cancer treatments targeting these tumor-promoting immune cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,346
Score d'incertitude au seuil0,876

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,055
Tête enseignante GPT0,287
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle