Loss of imprinting and abnormal expression of the insulin‐like growth factor 2 gene in gastric cancer
Notice bibliographique
Résumé
This study examined the frequency of loss of imprinting (LOI) and expression of the insulin-like growth factor 2 (IGF2) gene, and their relationship to selected clinical and pathological factors, in a well defined series of 90 Chinese patients with gastric cancer (GC) and 90 matched patients (controls) diagnosed with nonmalignant conditions. Using peripheral blood and gastric tissue samples, polymerase chain reaction-based assays and restriction endonuclease (Apa I) digestion revealed 33 GC patients and 21 controls to be Apa I informative. LOI of IGF2 was positive in 48.5% (16/33) of primary GC tumor tissues, in 21.2% (7/33) of histologically normal adjacent gastric mucosa (AM) and in 12.1% (4/33) of distant gastric mucosa (DM), and in 15.2% (5/33) of peripheral blood lymphocytes (PBLs). The prevalence of IGF2 LOI in PBL was not statistically different between GC patients (5/33, 15.2%) and control subjects (2/21, 9.5%), P = 0.69. Although patients who were found to have LOI of IGF2 were more likely to have advanced stage gastric tumors (P = 0.04), no statistically significant differences in survival were found based on imprinting status. IGF2 LOI was associated with an increased expression of IGF2 level in both tumors (P < 0.01) and blood (P < 0.01). The results of this study implicate IGF2 LOI in the molecular pathogenesis of GC, most likely through increased IGF2 expression. Although the precise molecular mechanisms by which LOI of IGF2 increases GC risk require further study, LOI of IGF2 may be a potentially important clinical epigenetic marker to identify individuals at increased risk for gastric malignancy.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».