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Enregistrement W2126325884 · doi:10.1099/0022-1317-83-2-291

Herpes simplex virus type 1 glycoprotein C is necessary for efficient infection of chondroitin sulfate-expressing gro2C cells

2002· article· en· W2126325884 sur OpenAlexaff
Kristina Mårdberg, Edward Trybala, Frank Tufaro, Tomas Bergström

Notice bibliographique

RevueJournal of General Virology · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProteoglycans and glycosaminoglycans research
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésVirologyBiologyHerpes simplex virusGlycoproteinChondroitin sulfateVirusMicrobiologyMolecular biologyGlycosaminoglycanBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The role of glycoprotein C (gC) for binding of herpes simplex virus type 1 (HSV-1) to cell surface chondroitin sulfate (CS) and the consequences of this interaction for virus attachment and infectivity were studied. To this end, a panel of HSV-1 gC mutants, including a gC-negative (gC(-)) variant, and mouse fibroblasts expressing either cell surface CS or heparan sulfate (HS) were used. Comparing gC-positive (gC(+)) and gC(-) viruses in terms of their attachment to and infection of CS-expressing cells indicated that gC was essential for both functions. Furthermore, purified gC bound efficiently to isolated CS chains. However, hypertonic NaCl disrupted this interaction more easily as compared to the binding of gC to HS. Also, native and selectively desulfated heparins were approximately 10 times more efficient at inhibiting gC binding to CS-expressing cells than binding to HS-expressing cells. Experiments with the HSV-1 gC mutants revealed that specific, positively charged and hydrophobic amino acids within the N-terminal part of the protein were responsible for efficient binding as well as infectivity in both CS- and HS-expressing cells. When the infectivity of the gC mutants in the two cell types was compared, it appeared that more residues contributed to the infection of CS-expressing cells than to infection of HS-expressing cells. Taken together, analysis of gC function in cell systems with limited expression of glycosaminoglycans revealed that gC could interact with either CS or HS and that these interactions exhibited subtle but definite differences as regards to the involved structural features of gC, ionic strength dependency as well as sensitivity to specifically desulfated heparin compounds.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,287
Écart entre enseignants0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations77
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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