Tissue Distribution and Gender-Divergent Expression of 78 Cytochrome P450 mRNAs in Mice
Notice bibliographique
Résumé
Cytochrome P450 (Cyp) enzymes from the first four families (Cyp1-4) play a major role in metabolizing xenobiotics, affecting drug pharmacokinetics and chemical-induced toxicity. Due to cloning of the mouse genome, many novel Cyp isoforms have been identified, but their tissue distribution of expression is unknown. This study compared the tissue distribution of all 78 Cyps from the Cyp1-4 families in C57BL/6 mice providing not only an indication of which tissues novel Cyps may have their greatest importance but also a cohesive comparison of the tissue distribution of all Cyp1-4 isoforms. Transcripts of the 78 Cyps were quantified by multiplex suspension arrays and quantitative real-time PCR in 14 tissues. Hierarchical clustering indicated that in male mice, 52% of the Cyp species were expressed highest in liver, 10% in kidney, 10% in duodenum/jejunum, 10% in testes, 5% in lung, and < 4% in colon, brain, heart, and stomach. Female mice had a similar pattern of Cyp messenger RNA expression; however, compared with males, females had 7% more Cyps that were liver predominant, 2% more Cyps that were stomach predominant, but 1% less Cyps that were kidney and lung predominant. Differences in gender expression were observed in 29 of the Cyps, with 24 being higher in females than males. Additionally, the data suggest a correlation between the spatial arrangement of genes within a gene cluster and their organ-predominant expression, indicating a common regulatory mechanism may be present within these clusters. In conclusion, this study provides novel data on the tissue distribution and gender-divergent expression of 78 functional mouse Cyp isoforms.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».