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Enregistrement W2126385448 · doi:10.1002/dvdy.20721

The <i>hedgehog</i>‐related gene <i>qua‐1</i> is required for molting in <i>Caenorhabditis elegans</i>

2006· article· en· W2126385448 sur OpenAlexafffund
Limin Hao, Krishanu Mukherjee, Samuel Liégeois, David L. Baillie, Michel Labouesse, Thomas R. Bürglin

Notice bibliographique

RevueDevelopmental Dynamics · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics, Aging, and Longevity in Model Organisms
Établissements canadiensSimon Fraser University
Organismes subventionnairesNational Center for Research ResourcesNational Institutes of HealthNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesGenome British ColumbiaStiftelsen för Strategisk ForskningGenome Canada
Mots-clésBiologyCaenorhabditis elegansGeneGeneticsCell biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Caenorhabditis elegans genome encodes ten proteins that share similarity with Hedgehog through the C-terminal Hint/Hog domain. While most genes are members of larger gene families, qua-1 is a single copy gene. Here we show that orthologs of qua-1 exist in many nematodes, including Brugia malayi, which shared a common ancestor with C. elegans about 300 million years ago. The QUA-1 proteins contain an N-terminal domain, the Qua domain, that is highly conserved, but whose molecular function is not known. We have studied the expression pattern of qua-1 in C. elegans using a qua-1::GFP transcriptional fusion. qua-1 is mainly expressed in hyp1 to hyp11 hypodermal cells, but not in seam cells. It is also expressed in intestinal and rectal cells, sensilla support cells, and the P cell lineage in L1. The expression of qua-1::GFP undergoes cyclical changes during development in phase with the molting cycle. It accumulates prior to molting and disappears between molts. Disruption of the qua-1 gene function through an internal deletion that causes a frame shift with premature stop in the middle of the gene results in strong lethality. The animals arrest in the early larval stages due to defects in molting. Electron microscopy reveals double cuticles due to defective ecdysis, but no obvious defects are seen in the hypodermis. Qua domain-only::GFP and full-length QUA-1::GFP fusion constructs are secreted and associated with the overlying cuticle, but only QUA-1::GFP rescues the mutant phenotype. Our results suggest that both the Hint/Hog domain and Qua domain are critically required for the function of QUA-1.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,201
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations47
Publié2006
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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