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Enregistrement W2126442818 · doi:10.1128/mcb.26.9.3353-3364.2006

Leaky Scanning and Reinitiation Regulate <i>BACE1</i> Gene Expression

2006· article· en· W2126442818 sur OpenAlexaff
Weihui Zhou, Weihong Song

Notice bibliographique

RevueMolecular and Cellular Biology · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAlzheimer's disease research and treatments
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyAmyloid precursor proteinOpen reading frameMolecular biologyGene expressionUpstream open reading frameGeneUntranslated regionMessenger RNAGeneticsAlzheimer's diseasePeptide sequence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

beta-Site beta-amyloid precursor protein (APP)-cleaving enzyme 1 (BACE1) is the beta-secretase in vivo for processing APP to generate amyloid beta protein (Abeta). Abeta deposition in the brain is the hallmark of Alzheimer's disease (AD) neuropathology. Inhibition of BACE1 activity has major pharmaceutical potential for AD treatment. The expression of the BACE1 gene is relatively low in vivo. The control of BACE1 expression has not been well defined. There are six upstream AUGs (uAUGs) in the 5' leader sequence of the human BACE1 mRNA. We investigated the role of the promoter and the uATGs in the 5' untranslated region (UTR) of the human BACE1 gene in BACE1 gene transcription and translation initiation. Our results show that the first and second uATGs are the integral part of the core minimal promoter of the human BACE1 gene, while the third uAUG is skipped over by ribosomal scanning. The fourth uAUG can function as a translation initiation codon, and deletion or mutation of this uAUG increases downstream gene expression. The fourth uAUG of the BACE1 5'UTR is responsible for inhibiting the expression of BACE1. Translation initiation by the BACE1 uAUGs and physiological AUG requires intact eIF4G. Our results demonstrate that during human BACE1 gene expression, ribosomes skipped some uAUGs by leaky scanning and translated an upstream open reading frame, initiated efficiently at the fourth uAUG, and subsequently reinitiated BACE1 translation at the physiological AUG site. Such leaky scanning and reinitiation resulted in weak expression of BACE1 under normal conditions. Alterations of the leaky scanning and reinitiation in BACE1 gene expression could play an important role in AD pathogenesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,030
Score d'incertitude au seuil0,387

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations84
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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