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Enregistrement W2126468077 · doi:10.3389/fgene.2014.00086

Elucidating the interactions between the human gut microbiota and its host through metabolic modeling

2014· review· en· W2126468077 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Genetics · 2014
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGut microbiota and health
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesKnut och Alice Wallenbergs StiftelseFondation ChalmersTorsten Söderbergs Stiftelse
Mots-clésGut floraMicrobiomeBiologyHost (biology)Computational biologyGut microbiomeHuman healthHuman microbiomeGut bacteriaImmune systemBioinformaticsEcologyGeneticsImmunologyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Increased understanding of the interactions between the gut microbiota, diet and environmental effects may allow us to design efficient treatment strategies for addressing global health problems. Existence of symbiotic microorganisms in the human gut provides different functions for the host such as conversion of nutrients, training of the immune system, and resistance to pathogens. The gut microbiome also plays an influential role in maintaining human health, and it is a potential target for prevention and treatment of common disorders including obesity, type 2 diabetes, and atherosclerosis. Due to the extreme complexity of such disorders, it is necessary to develop mathematical models for deciphering the role of its individual elements as well as the entire system and such models may assist in better understanding of the interactions between the bacteria in the human gut and the host by use of genome-scale metabolic models (GEMs). Recently, GEMs have been employed to explore the interactions between predominant bacteria in the gut ecosystems. Additionally, these models enabled analysis of the contribution of each species to the overall metabolism of the microbiota through the integration of omics data. The outcome of these studies can be used for proposing optimal conditions for desired microbiome phenotypes. Here, we review the recent progress and challenges for elucidating the interactions between the human gut microbiota and host through metabolic modeling. We discuss how these models may provide scaffolds for analyzing high-throughput data, developing probiotics and prebiotics, evaluating the effects of probiotics and prebiotics and eventually designing clinical interventions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,941
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,049
Tête enseignante GPT0,353
Écart entre enseignants0,304 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle