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Enregistrement W2126491616 · doi:10.1183/09031936.00010111

Nomogram to predict the presence of<i>EGFR</i>activating mutation in lung adenocarcinoma

2011· article· en· W2126491616 sur OpenAlexaff
Nicolas Girard, Camelia S. Sima, D. M. Jackman, Lecia V. Sequist, H. Chen, James Chih‐Hsin Yang, H Ji, Belinda A. Waltman, Rafael Rosell, Miquel Tarón, Maureen F. Zakowski, Marc Ladanyi, Greg J. Riely, William Pao

Notice bibliographique

RevueEuropean Respiratory Journal · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLung Cancer Treatments and Mutations
Établissements canadiensInstitute for Biological Sciences
Organismes subventionnairesNational Taiwan UniversityNational Taiwan University HospitalDana-Farber Cancer InstituteMemorial Sloan-Kettering Cancer Center
Mots-clésMedicineNomogramAdenocarcinomaLungMutationOncologyAdenocarcinoma of the lungLung cancerInternal medicineCancer researchGeneticsCancerGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Epidermal growth factor receptor (EGFR) tumour genotyping is crucial to guide treatment decisions regarding the use of EGFR tyrosine kinase inhibitors in nonsmall cell lung cancer (NSCLC). However, some patients may not be able to obtain tumour testing, either because tissue is limited and/or tests are not routinely offered. Here, we aimed to build a model-based nomogram to allow for prediction of the presence of EGFR mutations in NSCLC. We retrospectively collected clinical and pathological data on 3,006 patients with NSCLC who had their tumours genotyped for EGFR mutations at five institutions worldwide. Variables of interest were integrated in a multivariate logistic regression model. In the 2,392 non-Asian patients with lung adenocarcinomas, the most important predictors of harbouring EGFR mutation were: lower tobacco smoking exposure (OR 0.41, 95% CI 0.37-0.46), longer time interval between smoking cessation and diagnosis (OR 2.19, 95% CI 1.71-2.80), advanced stage (OR 1.58, 95% CI 1.18-2.13), and papillary (OR 4.57, 95% CI 3.14-6.66) or bronchioloalveolar (OR 2.84, 95% CI 1.98-4.06) histologically predominant subtype. A nomogram was established and showed excellent discriminating accuracy: the concordance index on an independent validation dataset was 0.84. As clinical practices transition to incorporating genotyping as part of routine care, this nomogram could be highly useful to predict the presence of EGFR mutations in lung adenocarcinoma in non-Asian patients when mutational profiling is not available or possible.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,080
Score d'incertitude au seuil0,274

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,307
Écart entre enseignants0,269 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations112
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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