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Enregistrement W2126566164 · doi:10.1139/b09-006

Quantifying the growth of arbuscular mycorrhizal fungi: usefulness of the fractal dimension

2009· article· en· W2126566164 sur OpenAlexafffundvenue
Christine Juge, Annie Champagne, Andrew P. Coughlan, Nicolas Juge, Lael Parrott, Yves Piché

Notice bibliographique

RevueBotany · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueMycorrhizal Fungi and Plant Interactions
Établissements canadiensUniversité de MontréalUniversité LavalCenter for Northern StudiesUniversité du Québec à Montréal
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversité Laval
Mots-clésHyphaMyceliumBiologyBotanyFungusMycorrhizaFractal dimensionHorticultureFractalSymbiosisMathematicsBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The present study is, to the best of our knowledge, the first to investigate the use of the fractal dimension (FD) to quantify the growth and development of undisturbed, fully functional arbuscular mycorrhizal (AM) hyphae developing in vitro. The majority of the work focused on the model AM fungus Glomus intraradices DAOM 181602. The time course study and final measurements of an intact mature extraradical mycelium allowed us to compare the development of the mycelium and the FD value. The final FD value of 1.62 for the mature mycelium is similar to that obtained for highly branched root systems and tree crowns. The FD method was used to characterize the morphology of germinative and presymbiotic hyphae in the presence of stimulatory (strigolactone GR-24, 0.1 µmol·L –1 and bisphenol A, 10 µmol·L –1 ) and inhibitory (NaCl, 80 mmol·L –1 ) molecules, and the extraradical phase in the presence of an inhibitory molecule (NaCl, 80 mmol·L –1 ). Where possible, results were compared with those obtained using the traditional grid-line (GL) technique. The FD approach allowed treatment effects to be accurately quantified, both in germinative and extraradical phases. In the second case, this technique provided a single quantitative value of extraradical hyphal growth that included runner hyphae (RH) networks, and fine-branching (FB) ramifications. This is in contrast to the GL technique, which provides a value for the estimation of RH, but which is not suitable for accurately measuring FB hyphae. Given the ease with which the FD values can be calculated, and the fact that this method can provide a single value for the quantification of extraradical hyphal growth and development, we suggest that this method is useful for in vitro studies. Furthermore under certain situations of germinative or presymbiotic growth, it may be used in concert with the GL method to provide a greater degree of information about hyphal morphology. The usefulness and limits of the FD method at different stages of the AM fungal growth cycle are discussed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,790
Score d'incertitude au seuil0,526

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,199 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2009
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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