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Cloning, sequencing, and expression analysis of mouse glucosamine-6-phosphate deaminase (GNPDA/oscillin)

2000· article· en· W2126672537 sur OpenAlexaff
Pascal Amireault, Fran�ois Dub�

Notice bibliographique

RevueMolecular Reproduction and Development · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueReproductive Biology and Fertility
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyHamsterMolecular biologyMessenger RNACloning (programming)Complementary DNAOocyteSpermMesocricetusImmunofluorescenceChinese hamster ovary cellBlotEmbryoGeneAntibodyCell biologyReceptorGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

It was reported that a hamster protein, called "oscillin," with a sequence related to that of an Escherichia coli GNPDA triggered Ca(2+) oscillations in mammalian oocytes when introduced into their cytoplasm upon fertilization. Recently, it was shown that GNPDA/oscillin is ubiquitously expressed in rat tissues and that a recombinant hamster GNPDA/oscillin protein does not exhibit oscillin activity when injected into oocytes. In the mouse, the nature and role of such a GNPDA/oscillin is not known, but another candidate protein, tr-kit, has been proposed as a sperm factor causing oocyte activation. In order to clarify this issue, we have characterized the mouse homolog of hamster and human GNPDA/oscillin, and examined its expression along with that of tr-kit, in parallel. We report here the molecular cloning and sequencing of mouse GNPDA/oscillin, which shows over 96% identity with the hamster and human homologs. Using specific primers, we performed an RT-PCR analysis to determine the tissue distribution of mouse GNPDA/oscillin mRNA. Unlike tr-kit mRNA which is expressed solely in mouse testis, GNPDA/oscillin mRNA is detected in unfertilized oocytes and in all tissues examined including testis, heart, thymus, liver, ovary, uterus, kidney, spleen, and lung. The protein itself is also detected in all tissues examined by Western blots. Indirect immunofluorescence studies, using an antibody raised against hamster GNPDA, demonstrate that GNPDA is lost with the acrosome reaction of mouse spermatozoa, is localized in the equatorial and neck regions of the human spermatozoa and the post-acrosomal region of the hamster spermatozoa. Our results thus indicate that mouse GNPDA/oscillin, the homolog of hamster oscillin, unlike tr-kit, does not exhibit some of the required characteristics expected from a putative sperm-derived oocyte-activating factor.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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