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Enregistrement W2126833019 · doi:10.1136/jmg.2010.079814

Germline mutations in <i>CDH1</i> are infrequent in women with early-onset or familial lobular breast cancers

2010· article· en· W2126833019 sur OpenAlexafffund
Kasmintan A. Schrader, Serena Masciari, Niki Boyd, Clara Salamanca, Janine Senz, Darren N. Saunders, Erika Yorida, Sarah Maines‐Bandiera, Pardeep Kaurah, Nadine Tung, Mark E. Robson, Paula D. Ryan, Olufunmilayo I. Olopade, Susan M. Domchek, James M. Ford, Claudine Isaacs, Powel H. Brown, Judith Balmañà, A. Rab Razzak, Penelope Miron, Kelly Coffey, Mary Beth Terry, Esther M. John, Irene L. Andrulis, Julia A. Knight, F P O’Malley, Mary B. Daly, Paulo Franscisco Mascarenhas Bender, Raymond M. Moore, Melissa C. Southey, John L. Hopper, Judy E. Garber, David G. Huntsman

Notice bibliographique

RevueJournal of Medical Genetics · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueWnt/β-catenin signaling in development and cancer
Établissements canadiensGenome British ColumbiaSt. Michael's HospitalCancer Care OntarioLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteMount Sinai HospitalUniversity of TorontoBC Cancer AgencyUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteBC Cancer AgencyMedical Research CouncilNational Institutes of HealthNational Breast Cancer FoundationCharles A. King TrustUniversity of MelbourneCommonwealth of MassachusettsHarvard UniversityCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreMassachusetts General HospitalMemorial Sloan-Kettering Cancer CenterHuntsman Cancer InstituteNational Center for Research ResourcesCancer Institute NSWUniversity of PennsylvaniaCancer Care OntarioNational Health and Medical Research CouncilGeorgetown UniversityHarvard CatalystUniversity of British ColumbiaBreast Cancer Research Foundation
Mots-clésCDH1Breast cancerGermline mutationGermlineFamily historyCancerMedicinePALB2OncologyMutationGeneticsInternal medicineBiologyGeneCadherin

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Germline mutations in CDH1 are associated with hereditary diffuse gastric cancer; lobular breast cancer also occurs excessively in families with such condition. METHOD: To determine if CDH1 is a susceptibility gene for lobular breast cancer in women without a family history of diffuse gastric cancer, germline DNA was analysed for the presence of CDH1 mutations in 318 women with lobular breast cancer who were diagnosed before the age of 45 years or had a family history of breast cancer and were not known, or known not, to be carriers of germline mutations in BRCA1 or BRCA2. Cases were ascertained through breast cancer registries and high-risk cancer genetic clinics (Breast Cancer Family Registry, the kConFab and a consortium of breast cancer genetics clinics in the United States and Spain). Additionally, Multiplex Ligation-dependent Probe Amplification was performed for 134 cases to detect large deletions. RESULTS: No truncating mutations and no large deletions were detected. Six non-synonymous variants were found in seven families. Four (4/318 or 1.3%) are considered to be potentially pathogenic through in vitro and in silico analysis. CONCLUSION: Potentially pathogenic germline CDH1 mutations in women with early-onset or familial lobular breast cancer are at most infrequent.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,065
Score d'incertitude au seuil0,417

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations82
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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