A synthetic analysis of the Saccharomyces cerevisiae stress sensor Mid2p, and identification of a Mid2p-interacting protein, Zeo1p, that modulates the PKC1–MPK1 cell integrity pathway
Notice bibliographique
Résumé
Mid2p is a plasma membrane protein that functions in Saccharomyces cerevisiae as a sensor of cell wall stress, activating the PKC1-MPK1 cell integrity pathway via the small GTPase Rho1p during exposure to mating pheromone, calcofluor white, and heat. To examine Mid2p signalling, a global synthetic interaction analysis of a mid2 mutant was performed; this identified 11 interacting genes. These include WSC1 and ROM2, upstream elements in cell integrity pathway signalling, and FKS1 and SMI1, required for 1,3-beta-glucan synthesis. These synthetic interactions indicate that the Wsc1p sensor acts through Rom2p to activate the Fks1p glucan synthase in a Mid2p-independent way. To further explore Mid2p signalling a two-hybrid screen was done using the cytoplasmic tail of Mid2p; this identified ZEO1 (YOL109w), encoding a 12 kDa peripheral membrane protein that localizes to the plasma membrane. Disruption of ZEO1 leads to resistance to calcofluor white and to a Mid2p-dependent constitutive phosphorylation of Mpk1p, supporting a role for Zeo1p in the cell integrity pathway. Consistent with this, zeo1-deficient cells suppress the growth defect of mutants in the Rho1p GDP-GTP exchange factor Rom2p, while exacerbating the growth defect of sac7delta mutants at 37 degrees C. In contrast, mid2delta mutants have opposing effects to zeo1delta mutants, being synthetically lethal with rom2delta, and suppressing an 18 degrees C growth defect of sac7delta, while overexpression of MID2 rescues a rom2delta 37 degrees C growth defect. Thus, MID2 and ZEO1 appear to play reciprocal roles in the modulation of the yeast PKC1-MPK1 cell integrity pathway.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».