MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2126917641 · doi:10.1046/j.1365-2958.2002.03112.x

A third envelope stress signal transduction pathway in <i>Escherichia coli</i>

2002· article· en· W2126917641 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueMolecular Microbiology · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial Genetics and Biotechnology
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesFondation pour la Recherche Médicale
Mots-clésBiologyPeriplasmic spaceSignal transductionRegulonMutantCell envelopeCell biologyBacterial outer membraneGeneEscherichia coliGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Escherichia coli uses overlapping envelope stress responses to adapt to insults to the bacterial envelope that cause protein misfolding. The sigmaE and Cpx envelope stress responses are activated by both common and distinct envelope stresses and respond by increasing the expression of the periplasmic protease DegP as well as target genes unique to each response. The sigmaE pathway is involved in outer membrane protein (OMP) folding quality control whereas the Cpx pathway plays an important role in the assembly of at least one pilus. Previously, we identified the spy gene as a new Cpx regulon member of unknown function. Interestingly, induction of spy expression by severe envelope stresses such as spheroplasting is only partially dependent on an intact Cpx signalling pathway, unlike other Cpx-regulated genes. Here we show that the BaeS sensor kinase and BaeR response regulator also control expression of spy in response to envelope stress. BaeS and BaeR do not affect expression of other known Cpx-regulated genes, however, baeR cpxR double mutants show increased sensitivity to envelope stresses relative to either single mutant alone. We propose that the Bae signal transduction pathway controls a third envelope stress response in E. coli that induces expression of a distinct set of adaptive genes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,127
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,186
Écart entre enseignants0,179 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle