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Enregistrement W2126944439 · doi:10.18632/oncotarget.4546

Genetic determinants of FOXM1 overexpression in epithelial ovarian cancer and functional contribution to cell cycle progression

2015· article· en· W2126944439 sur OpenAlexaffabout
Carter J. Barger, Wa Zhang, Joanna C. Hillman, Aimee Stablewski, Michael J. Higgins, Barbara C. Vanderhyden, Kunle Odunsi, Adam R. Karpf

Notice bibliographique

RevueOncotarget · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueFOXO transcription factor regulation
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesCancer Institute, University of PittsburghUniversity of Illinois at Urbana-ChampaignNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthQueen Mary University of LondonOvarian Cancer Research FundRoswell Park Cancer InstituteU.S. Department of Defense
Mots-clésFOXM1Cancer researchOvarian cancerCell cycleCell cycle progressionCell growthBiologyMedicineCancerBioinformaticsOncologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

// Carter J. Barger 1 , Wa Zhang 1 , Joanna Hillman 2 , Aimee B. Stablewski 2 , Michael J. Higgins 2 , Barbara C. Vanderhyden 3 , Kunle Odunsi 4, 5, 6 , Adam R. Karpf 1 1 Eppley Institute and Fred & Pamela Buffett Cancer Center, University of Nebraska Medical Center, Omaha, NE, 68198, USA 2 Department of Molecular and Cellular Biology, Roswell Park Cancer Institute, Buffalo, NY, 14263, USA 3 Department of Cellular and Molecular Medicine, University of Ottawa, Ottawa, Ontario, K1H 8M5, Canada 4 Department of Immunology, Roswell Park Cancer Institute, Buffalo, NY, 14263, USA 5 Department of Gynecologic Oncology, Roswell Park Cancer Institute, Buffalo, NY, 14263, USA 6 Center for Immunotherapy, Roswell Park Cancer Institute, Buffalo, NY, 14263, USA Correspondence to: Adam R. Karpf, e-mail: adam.karpf@unmc.edu Keywords: FOXM1, epithelial ovarian cancer, p53, Rb, E2F1 Received: March 17, 2015 Accepted: July 06, 2015 Published: July 16, 2015 ABSTRACT The FOXM1 transcription factor network is frequently activated in high-grade serous ovarian cancer (HGSOC), the most common and lethal subtype of epithelial ovarian cancer (EOC). We used primary human EOC tissues, HGSOC cell lines, mouse and human ovarian surface epithelial (OSE) cells, and a murine transgenic ovarian cancer model to investigate genetic determinants of FOXM1 overexpression in EOC, and to begin to define its functional contribution to disease pathology. The Cancer Genome Atlas (TCGA) data indicated that the FOXM1 locus is amplified in ~12% of HGSOC, greater than any other tumor type examined, and that FOXM1 amplification correlates with increased expression and poor survival. In an independent set of primary EOC tissues, FOXM1 expression correlated with advanced stage and grade. Of the three known FOXM1 isoforms, FOXM1c showed highest expression in EOC. In murine OSE cells, combined knockout of Rb1 and Trp53 synergistically induced FOXM1. Consistently, human OSE cells immortalized with SV40 Large T antigen (IOSE-SV) had significantly higher FOXM1 expression than OSE immortalized with hTERT (IOSE-T). FOXM1 was overexpressed in murine ovarian tumors driven by combined Rb1 / Trp53 disruption. FOXM1 induction in IOSE-SV cells was partially dependent on E2F1, and FOXM1 expression correlated with E2F1 expression in human EOC tissues. Finally, FOXM1 functionally contributed to cell cycle progression and relevant target gene expression in human OSE and HGSOC cell models. In summary, gene amplification, p53 and Rb disruption, and E2F1 activation drive FOXM1 expression in EOC, and FOXM1 promotes cell cycle progression in EOC cell models.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,274
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations93
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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