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Enregistrement W2126990727 · doi:10.1128/aac.00297-09

Epidemic Clonal Groups of <i>Escherichia coli</i> as a Cause of Antimicrobial-Resistant Urinary Tract Infections in Canada, 2002 to 2004

2009· article· en· W2126990727 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.

Notice bibliographique

RevueAntimicrobial Agents and Chemotherapy · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEscherichia coli research studies
Établissements canadiensUniversity of ManitobaHealth Sciences Centre
Organismes subventionnairesOffice of Research and DevelopmentPfizerProcter and GambleU.S. Department of Veterans Affairs
Mots-clésEscherichia coliBiologyMicrobiologyVirulenceGenotypeAntibiotic resistanceCephalosporinAntimicrobialTrimethoprimDrug resistanceSulfamethoxazoleAntibioticsGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The extent to which clonal spread contributes to emerging antimicrobial resistance in Escherichia coli is incompletely defined. To address this question within a recent, nationally representative strain collection, three established drug-resistant E. coli clonal groups (i.e., clonal group A, E. coli O15:K52:H1, and sequence type 131 [ST131]) were sought among 199 E. coli urine isolates recovered from across Canada from 2002 to 2004, with stratification by resistance to trimethoprim-sulfamethoxazole (TS) and fluoroquinolones (FQs). The isolates' clonal backgrounds, virulence genotypes, and macrorestriction profiles were assessed. The three clonal groups were found to account for 37.2% of isolates overall, but accounted for 0% of TS-susceptible (TS-S) and FQ-susceptible (FQ-S) isolates, 20% of TS-resistant (TS-R) and FQ-S isolates, 60% of TS-S and FQ-R isolates, and 68% of TS-R and FQ-R isolates (P < 0.001). E. coli ST131, the most prevalent clonal group, accounted for 23.1% of isolates overall and for 44% of the FQ-R isolates. Nearly all ST131 isolates were FQ-R (96%) but, notably, cephalosporin susceptible (98%). Although the distinctive virulence profiles of the FQ-R clonal group isolates were less extensive than those of the susceptible isolates, they were significantly more extensive than those of the other FQ-R isolates. These findings indicate that among the E. coli urine isolates studied, resistance to TS and FQs has a prominent clonal component, with the O15:K52:H1 clonal group and especially E. coli ST131 being the major contributors. These clonal groups appear to be more virulent than comparably resistant isolates, possibly contributing to their success as emerging multi-drug-resistant pathogens.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,495
Score d'incertitude au seuil0,945

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle