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Enregistrement W2127003779 · doi:10.1158/1078-0432.ccr-11-0034

<i>BRAF-KIAA1549</i> Fusion Predicts Better Clinical Outcome in Pediatric Low-Grade Astrocytoma

2011· article· en· W2127003779 sur OpenAlexaff
Cynthia Hawkins, Erin J. Walker, Nequesha S. Mohamed, Cindy Zhang, Karine Jacob, Margret Shirinian, Noa Alon, Daniel Kahn, Iris Fried, Katrin Scheinemann, Elena Tsangaris, Peter B. Dirks, Robert Tressler, Éric Bouffet, Nada Jabado, Uri Tabori

Notice bibliographique

RevueClinical Cancer Research · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGlioma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensSickKids FoundationMcMaster Children's HospitalMcGill University Health CentreHospital for Sick ChildrenMontreal Children's Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFusion geneMedicineOncologyInternal medicineMultivariate analysisCancer researchPathologyBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: Recent studies have revealed that the majority of pediatric low-grade astrocytomas (PLGA) harbor the BRAF-KIAA1549 (B-K) fusion gene resulting in constitutive activation of the RAS/MAPK pathway. However, the clinical significance of this genetic alteration is yet to be determined. We aimed to test the prognostic role of the B-K fusion in progression of incompletely resected PLGA. EXPERIMENTAL DESIGN: We retrospectively identified 70 consecutive patients with incompletely resected "clinically relevant" PLGA. We added 76 tumors diagnosed at our institution between 1985 and 2010 as controls. We examined BRAF alterations by reverse transcriptase PCR, FISH, and single-nucleotide polymorphism array analysis and correlated that with progression-free survival (PFS). RESULTS: Overall, 60% of tumors were B-K fusion positive. All patients with B-K fused PLGA are still alive. Five-year PFS was 61% ± 8% and 18% ± 8% for fusion positive and negative patients, respectively (P = 0.0004). B-K fusion resulted in similarly significant favorable PFS for patients who received chemotherapy. Multivariate analysis revealed that B-K fusion was the most significant favorable prognostic factor in incompletely resected PLGA and was independent of location, pathology, and age. In vitro, BRAF overexpression resulted in growth arrest associated with DNA damage (γH2AX expression). Five-year PFS was 68% ± 15% and 0% for patients with B-K fused and γH2AX-expressing PLGA versus negative tumors (P = 0.001). CONCLUSION: These data suggest that B-K fusion confers a less aggressive clinical phenotype on PLGA and may explain their tendency to growth arrest. Combined analysis of B-K fusion and γH2AX expression can determine prognosis and may be a powerful tool to tailor therapy for these patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,024
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,394
Tête enseignante GPT0,535
Écart entre enseignants0,141 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations241
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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