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Enregistrement W2127032313 · doi:10.3892/ol.2011.482

Association of estrogen receptor α gene PvuII and XbaI polymorphisms with non-small cell lung cancer

2011· article· en· W2127032313 sur OpenAlexaff
Huai-Lu Chang, Yu‐Jen Cheng, Chung‐Kuang Su, Meng-Chih Chen, Fu-Hsin Chang, Fu‐Gong Lin, Lifeng Liu, Shyng‐Shiou F. Yuan, Ming‐Chih Chou, Chien-Fu Huang, Chi‐Chiang Yang

Notice bibliographique

RevueOncology Letters · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEstrogen and related hormone effects
Établissements canadiensNational Defence Medical Centre
Organismes subventionnairesChung Shan Medical UniversityI-Shou University
Mots-clésGenotypeLung cancerBiologySingle-nucleotide polymorphismInternal medicineLinkage disequilibriumEstrogen receptorHaplotypeCancerRestriction fragment length polymorphismGeneticsBreast cancerGeneMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Single nucleotide polymorphisms (SNPs) of the estrogen receptor (ER)-α have been found to be associated with various diseases at significantly different frequencies. However, whether any relationship exists between ER-α polymorphisms and lung cancer remains to be determined. In this study, 84 non-smoking, female, non-small cell lung cancer patients with various stages of disease and 234 cancer-free reference controls were enrolled to examine the association of ER-α polymorphisms in lung cancer. Two restriction SNP sites, PvuII and XbaI, in the first intron of the ER-α gene were genotyped by polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism. The frequencies of the PvuII-XbaI haplotypes and genotypes in a Taiwanese population were revealed for the first time. Although the genotypic frequencies of two polymorphic sites of ER- α were in linkage disequilibrium for the lung cancer group (χ(2)=50.013, d.f.=4) and reference controls (χ(2)=60.797, d.f.=4); and 7 and 8 combined genotypes were present, respectively, the distribution and the major genotypes are different in the two groups (p<0.0001). The p-values for PvuII and XbaI genotypes were significantly different between the lung cancer and reference controls. The PP genotype presence was found to be significantly lower in the lung cancer group (P=0.005), whereas presence of the xx genotype was significantly higher (P=0.042). These findings suggested that the PP genotype had a lower risk of lung cancer; whereas the xx genotype had a higher risk. In comparison with other studies conducted in various populations, it is of note that the pX haplotype frequency of this study was higher than that of other studies, whereas the px haplotype was lower. Moreover, the Xx genotypic frequency of XbaI polymorphisms in the ER-α gene of the reference control group was found to be extremely high, whereas the xx genotypic frequency was extremely low. In conclusion, PvuII-XbaI polymorphisms of the ER-α gene were found to be associated with the risk, but not cancer severity, of non-small cell lung cancer in a Taiwanese population.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,210
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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