Low genetic diversity, moderate local adaptation, and phylogeographic insights in <i>Cornus nuttallii</i> (Cornaceae)
Notice bibliographique
Résumé
PREMISE OF THE STUDY: Genetic knowledge is completely lacking for Pacific dogwood (Cornus nuttallii), a western North American temperate tree that is pollinated and dispersed by biological vectors. We investigated how history, geography, and climate have affected population genetic structure, local adaptation, and the phylogeography of this species. METHODS: We examined patterns and levels of diversity in nuclear microsatellites (SSRs) and cpDNA haplotypes in populations from across the species range. We compared these results to population differentiation and genetic clines in phenotypic traits in a common garden. KEY RESULTS: Genetic diversity was low for both nuclear SSRs and cpDNA. There was a lack of population structure (F(ST) = 0.090) in the coastal portion of the species range, with estimates of population genetic diversity in microsatellite markers decreasing with latitude from California to British Columbia. A disjunct interior population in Idaho 450 km from the coastal range had the lowest diversity but the highest divergence of all populations studied. Only a single nucleotide polymorphism was discovered after sequencing 5547 base pairs in seven noncoding regions of cpDNA. Both cpDNA haplotypes were widely distributed throughout the species range. Quantitative variation among populations was moderate (0.11 ≤ Q(ST) ≤ 0.63), and weak but significant adaptive clines were found between quantitative traits and population climatic variables (0.09 ≤ R(2) ≤ 0.34). CONCLUSIONS: Cornus nuttallii likely faced a population bottleneck in a single southern refugium during the Last Glacial Maximum. Despite low genetic diversity, it is weakly to moderately locally adapted.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».