MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2127076786 · doi:10.3732/ajb.1000466

Low genetic diversity, moderate local adaptation, and phylogeographic insights in <i>Cornus nuttallii</i> (Cornaceae)

2011· article· en· W2127076786 sur OpenAlexafffund
Karolyn R. Keir, Jordan B. Bemmels, Sally N. Aitken

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Botany · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesForest Genetics Council of British Columbia
Mots-clésBiologyGenetic diversityPopulationPhylogeographyRange (aeronautics)DisjunctEcologyIsolation by distanceNucleotide diversityLocal adaptationRefugium (fishkeeping)MicrosatelliteGenetic variationGenetic structureEvolutionary biologyHaplotypePhylogeneticsGeneticsAllele

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PREMISE OF THE STUDY: Genetic knowledge is completely lacking for Pacific dogwood (Cornus nuttallii), a western North American temperate tree that is pollinated and dispersed by biological vectors. We investigated how history, geography, and climate have affected population genetic structure, local adaptation, and the phylogeography of this species. METHODS: We examined patterns and levels of diversity in nuclear microsatellites (SSRs) and cpDNA haplotypes in populations from across the species range. We compared these results to population differentiation and genetic clines in phenotypic traits in a common garden. KEY RESULTS: Genetic diversity was low for both nuclear SSRs and cpDNA. There was a lack of population structure (F(ST) = 0.090) in the coastal portion of the species range, with estimates of population genetic diversity in microsatellite markers decreasing with latitude from California to British Columbia. A disjunct interior population in Idaho 450 km from the coastal range had the lowest diversity but the highest divergence of all populations studied. Only a single nucleotide polymorphism was discovered after sequencing 5547 base pairs in seven noncoding regions of cpDNA. Both cpDNA haplotypes were widely distributed throughout the species range. Quantitative variation among populations was moderate (0.11 ≤ Q(ST) ≤ 0.63), and weak but significant adaptive clines were found between quantitative traits and population climatic variables (0.09 ≤ R(2) ≤ 0.34). CONCLUSIONS: Cornus nuttallii likely faced a population bottleneck in a single southern refugium during the Last Glacial Maximum. Despite low genetic diversity, it is weakly to moderately locally adapted.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,127
Score d'incertitude au seuil0,457

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,193
Écart entre enseignants0,180 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueAmerican Journal of BotanyMême sujetGenetic diversity and population structureTravaux en français237 207