Validation of a Rapid Diagnostic Strategy for Determination of Significant Bacterial Counts in Bronchoalveolar Lavage Samples
Notice bibliographique
Résumé
CONTEXT: Bacterial cultures of bronchoscopic samples require 1 to 2 days for results to be available for use in clinical decisions. We developed a rapid diagnostic testing strategy that is highly sensitive for screening bacteria in bronchoalveolar lavage (BAL) samples, with results available within hours of collection. OBJECTIVE: To validate the ability of a bacterial adenosine triphosphate (ATP) assay and routine Gram stain microscopy to detect significant bacterial counts in BAL samples. DESIGN: Four hundred seventy-seven BAL samples from 319 patients suspected of having pneumonia were tested using a rapid diagnostic strategy, consisting of Gram stain and a bacterial ATP assay. Rapid results were compared with quantitative cultures with a positive cutoff of 10(4) CFU/mL or higher. RESULTS: Significant bacterial counts were identified in 107 samples (22%). The most common etiologic agents were Staphylococcus aureus (25%), Haemophilus influenzae (17%), and Streptococcus pneumoniae (12%). The rapid test results were false negative in 5 cases (S aureus in 2, both Klebsiella pneumoniae and S aureus in 1, and Stenotrophomonas maltophilia and S pneumoniae in 1 case each). The sensitivity, specificity, positive predictive value, negative predictive value, and accuracy of the rapid diagnostic strategy were 95.3%, 54.9%, 37.9%, 97.6%, and 63.9%, respectively. CONCLUSION: A negative result with this rapid diagnostic testing strategy rules out significant bacterial counts in BAL samples with a high degree of certainty and may allow use of narrow-spectrum antimicrobial agents or withholding of empiric antimicrobial therapy in patients suspected of having ventilator-associated pneumonia.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,019 | 0,039 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».