Identification and cloning of the bacterial nodulation specificity gene in the <i>Sinorhizobium meliloti</i> <i>Medicago laciniata</i> symbiosis
Notice bibliographique
Résumé
Medicago laciniata (cut-leaf medic) is an annual medic that is highly nodulation specific, nodulating only with a restricted range of Sinorhizobium meliloti. e.g., strain 102L4, but not with most strains that nodulate Medicago sativa (alfalfa), e.g., strains RCR2011 and Rm41. Our aim was to identify and clone the S. meliloti 102L4 gene implicated in the specific nodulation of M. laciniata and to characterize the adjacent nodulation (nod) region. An 11-kb EcoRI DNA fragment from S. meliloti 102L4 was shown to complement strain RCR2011 for nodulation of M. laciniata. Nucleotide sequencing revealed that this fragment contained nodABCIJ genes whose overall arrangement was similar to those found in strains RCR2011 and Rm41, which do not nodulate M. laciniata. Data for Tn5 mutagenesis of the nodABCIJ region of strain 102L4 suggested that the nodC gene was involved in the specific nodulation of M. laciniata. Tn5 insertions in the nodIJ genes gave mutants with nodulation delay phenotypes on both M. laciniata and M. sativa. Only subclones of the 11-kb DNA fragment containing a functional nodC gene from strain 102L4 were able to complement strain RCR2011 for nodulation of M. laciniata. The practical implications of these findings are discussed in the context of the development of a specific M. sativa - S. meliloti combination that excludes competition for nodulation by bacterial competitors resident in soil.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».