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Enregistrement W2127483142 · doi:10.1139/g06-152

Unisexual salamanders (genus Ambystoma) present a new reproductive mode for eukaryotes

2007· article· en· W2127483142 sur OpenAlexafffundvenue
James P. Bogart, Ke Bi, Jinzong Fu, Daniel W. A. Noble, John Niedzwiecki

Notice bibliographique

RevueGenome · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEvolution and Genetic Dynamics
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of Guelph
Mots-clésBiologyPolyploidParthenogenesisApomixisEvolutionary biologyMitochondrial DNASexual reproductionPloidyMicrosatelliteAsexual reproductionReproductive isolationHaplotypeGeneticsPopulationAllele

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

To persist, unisexual and asexual eukaryotes must have reproductive modes that circumvent normal bisexual reproduction. Parthenogenesis, gynogenesis, and hybridogenesis are the modes that have generally been ascribed to various unisexuals. Unisexual Ambystoma are abundant around the Great Lakes region of North America, and have variously been described as having all 3 reproductive modes. Diploid and polyploid unisexuals have nuclear genomes that combine the haploid genomes of 2 to 4 distinct sexual species, but the mtDNA is unlike any of those 4 species and is similar to another species, Ambystoma barbouri. To obtain better resolution of the reproductive mode used by unisexual Ambystoma and to explore the relationship of A. barbouri to the unisexuals, we sequenced the mitochondrial control and highly variable intergenic spacer region of 48 ambystomatids, which included 28 unisexuals, representatives of the 4 sexual species and A. barbouri. The unisexuals have similar sequences over most of their range, and form a close sister group to A. barbouri, with an estimated time of divergence of 2.4-3.9 million years ago. Individuals from the Lake Erie Islands (Kelleys, Pelee, North Bass) have a haplotype that demonstrates an isolation event. We examined highly variable microsatellite loci, and found that the genetic makeup of the unisexuals is highly variable and that unisexual individuals share microsatellite alleles with sexual individuals within populations. Although many progeny from the same female had the same genotype for 5 microsatellite DNA loci, there was no indication that any particular genome is consistently inherited in a clonal fashion in a population. The reproductive mode used by unisexual Ambystoma appears to be unique; we suggest kleptogenesis as a new unisexual reproductive mode that is used by these salamanders.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,284
Écart entre enseignants0,270 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations189
Publié2007
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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