Two molecular features contribute to the Argonaute specificity for the microRNA and RNAi pathways in <i>C. elegans</i>
Notice bibliographique
Résumé
In Caenorhabditis elegans, specific Argonaute proteins are dedicated to the RNAi and microRNA pathways. To uncover how the precise Argonaute selection occurs, we designed dsRNA triggers containing both miRNA and siRNA sequences. While dsRNA carrying nucleotides mismatches can only enter the miRNA pathway, a fully complementary dsRNA successfully rescues let-7 miRNA function and initiates silencing by RNAi. We demonstrated that RDE-1 is essential for RNAi induced by the perfectly paired trigger, yet is not required for silencing by the let-7 miRNA. In contrast, ALG-1/ALG-2 are required for the miRNA function, but not for the siRNA-directed gene silencing. Finally, a dsRNA containing a bulged miRNA and a perfectly paired siRNA can enter both pathways suggesting that the sorting of small RNAs occurs after that the dsRNA trigger has been processed by Dicer. Thus, our data suggest that the selection of Argonaute proteins is affected by two molecular features: (1) the structure of the small RNA duplex; and (2) the Argonautes specific characteristics.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».