The solution structure of ribosomal protein S17E from <i>Methanobacterium thermoautotrophicum</i>: A structural homolog of the FF domain
Notice bibliographique
Résumé
The ribosomal protein S17E from the archaeon Methanobacterium thermoautotrophicum is a component of the 30S ribosomal subunit. S17E is a 62-residue protein conserved in archaea and eukaryotes and has no counterparts in bacteria. Mammalian S17E is a phosphoprotein component of eukaryotic ribosomes. Archaeal S17E proteins range from 59 to 79 amino acids, and are about half the length of the eukaryotic homologs which have an additional C-terminal region. Here we report the three-dimensional solution structure of S17E. S17E folds into a small three-helix bundle strikingly similar to the FF domain of human HYPA/FBP11, a novel phosphopeptide-binding fold. S17E bears a conserved positively charged surface acting as a robust scaffold for molecular recognition. The structure of M. thermoautotrophicum S17E provides a template for homology modeling of eukaryotic S17E proteins in the family.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,002 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».