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Enregistrement W2127664187 · doi:10.1128/jvi.01642-13

Restriction of Virus Infection but Not Catalytic dNTPase Activity Is Regulated by Phosphorylation of SAMHD1

2013· article· en· W2127664187 sur OpenAlexfundno aff
Sarah Welbourn, Sucharita Dutta, O. John Semmes, Klaus Strebel

Notice bibliographique

RevueJournal of Virology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of Health
Mots-clésSAMHD1PhosphorylationBiologyMutantCell biologyMolecular biologyBiochemistryReverse transcriptaseRNAGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

SAMHD1 is a host protein responsible, at least in part, for the inefficient infection of dendritic, myeloid, and resting T cells by HIV-1. Interestingly, HIV-2 and SIVsm viruses are able to counteract SAMHD1 by targeting it for proteasomal degradation using their Vpx proteins. It has been proposed that SAMHD1 is a dGTP-dependent deoxynucleoside triphosphohydrolase (dNTPase) that restricts HIV-1 by reducing cellular dNTP levels to below that required for reverse transcription. However, nothing is known about SAMHD1 posttranslational modifications and their potential role in regulating SAMHD1 function. We used (32)P labeling and immunoblotting with phospho-specific antibodies to identify SAMHD1 as a phosphoprotein. Several amino acids in SAMHD1 were identified to be sites of phosphorylation using direct mass spectrometry. Mutation of these residues to alanine to prevent phosphorylation or to glutamic acid to mimic phosphorylation had no effect on the nuclear localization of SAMHD1 or its sensitivity to Vpx-mediated degradation. Furthermore, neither alanine nor glutamic acid substitutions had a significant effect on SAMHD1 dNTPase activity in an in vitro assay. Interestingly, however, we found that a T592E mutation, mimicking constitutive phosphorylation at a main phosphorylation site, severely affected the ability of SAMHD1 to restrict HIV-1 in a U937 cell-based restriction assay. In contrast, a T592A mutant was still capable of restricting HIV-1. These results indicate that SAMHD1 phosphorylation may be a negative regulator of SAMHD1 restriction activity. This conclusion is supported by our finding that SAMHD1 is hyperphosphorylated in monocytoid THP-1 cells under nonrestrictive conditions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,187
Score d'incertitude au seuil0,603

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations149
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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