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Enregistrement W2127751769 · doi:10.1534/genetics.108.096016

The Role of Protein Phosphatase 4 in Regulating Microtubule Severing in the<i>Caenorhabditis elegans</i>Embryo

2008· article· en· W2127751769 sur OpenAlexaff
Xue Han, José‐Eduardo Gomes, Cheryl L. Birmingham, Lionel Pintard, Asako Sugimoto, Paul E. Mains

Notice bibliographique

RevueGenetics · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics, Aging, and Longevity in Model Organisms
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCaenorhabditis elegansBiologyMeiosisPhosphataseRNA interferenceProtein subunitCell biologyMeiosis IIMutantMicrotubuleEctopic expressionGeneticsMolecular biologyPhosphorylationRNAGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

MEI-1, the catalytic subunit of the Caenorhabditis elegans "katanin" microtubule-severing complex, is required for meiotic spindle formation. However, MEI-1 must be inactivated after the completion of meiosis to allow formation of the first mitotic spindle. Recent work demonstrated that post-meiotic MEI-1 undergoes ubiquitin-dependent degradation mediated by two independent pathways. Here we describe another level of MEI-1 regulation involving the protein phosphatase 4 (PP4) complex. The PP4 R1 regulatory subunit protein phosphatase four regulatory subunit 1 (ppfr-1) was identified in an RNA interference (RNAi) screen for suppressors of a mei-1(gf) allele that is refractory to post-meiotic degradation. RNAi to the PP4 catalytic subunit PPH-4.1 or to the alpha4 regulatory PPFR-4 also suppressed lethality of ectopic MEI-1. These results suggest that PP4(+) activates MEI-1, and therefore loss of PP4 decreases ectopic MEI-1(gf) activity. PPH-4.1 and MEI-1 co-immunoprecipitate with one another, indicating that the PP4 complex likely regulates MEI-1 activity directly rather than through an intermediate. The ppfr-1 mutant has subtle meiotic defects indicating that PPFR-1 also regulates MEI-1 during meiosis. MBK-2 is the only kinase known to phosphorylate MEI-1 and triggers post-meiotic MEI-1 degradation. However, genetic interactions between PP4 and mbk-2 were not consistent with an antagonistic relationship between the phosphatase and kinase. Additionally, reducing PP4 in mei-1(gf) did not change the level or localization of post-meiotic MEI-1. Thus, by making use of a genetic background where MEI-1 is ectopically expressed, we have uncovered a third mechanism of MEI-1 regulation, one based on phosphorylation but independent of degradation. The redundant regulatory pathways likely contribute in different ways to the rapid and precise post-meiotic inactivation of MEI-1 microtubule-severing activity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,198
Écart entre enseignants0,192 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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