MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2127763051 · doi:10.1210/jc.2014-2857

Increased Prevalence of the<i>GCM2</i>Polymorphism, Y282D, in Primary Hyperparathyroidism: Analysis of Three Italian Cohorts

2014· article· en· W2127763051 sur OpenAlexafffund
Leonardo D’Agruma, Michela Coco, Vito Guarnieri, Claudia Battista, Lucie Canaff, Antonio Stefano Salcuni, Sabrina Corbetta, Filomena Cetani, Salvatore Minisola, Iacopo Chiodini, Cristina Eller-Vainicher, Anna Spada, Claudio Marcocci, Giuseppe Guglielmi, Michele Zini, Rosanna Clemente, Betty Wong, Danilo de Martino, Alfredo Scillitani, Geoffrey N. Hendy, David E.C. Cole

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Clinical Endocrinology & Metabolism · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueParathyroid Disorders and Treatments
Établissements canadiensMcGill UniversityRoyal Victoria HospitalUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésPrimary hyperparathyroidismCohortTransactivationEndocrinologyMissense mutationInternal medicineHyperparathyroidismMedicineBiologyGastroenterologyGeneticsPhenotypeGeneGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

CONTEXT: Glial cells missing-2 (GCM2) is key for parathyroid gland organogenesis. Its persistent expression in the adult parathyroid raises the possibility that overactive forms play a role in the evolution of parathyroid hyperactivity or tumorigenesis. A GCM2 c.844T → G; p.Y282D missense variant has been described within a transactivation inhibitory domain (amino acids 263-352). OBJECTIVE: The aims of the study were to 1) assess the frequency of Y282D in Italian primary hyperparathyroidism (PHPT) and control (C) populations, 2) test for association of 282D with PHPT and its phenotypic features, and 3) compare the transactivation potency of GCM2 282D relative to wild-type Y282. SUBJECTS AND METHODS: Subjects included a large southern Italian cohort (310 PHPT and 433 C) and 2 replication cohorts from northern Italy. Association of 282D with PHPT was tested in all cohorts and with phenotypic features in the larger PHPT cohort. An in vitro GCM promoter-luciferase reporter assay was conducted in HEK293 cells. RESULTS: 282D was significantly increased in the PHPT group, with a minor allele frequency of 0.066 compared with 0.029 in the C group (P = .0008), in the discovery cohort and was more prevalent in the replication cohorts. Combined analysis (510 PHPT and 665 C) yielded a likelihood ratio of 2.27 (95% confidence interval = 1.50-3.42; P < .0001). The 282D variant was not associated with serum calcium, phosphate, creatinine, or PTH levels or with bone mineral density, fractures, or renal stones in the PHPT group. The 282D variant had significantly greater transcriptional activity than the wild-type Y282 (17× basal vs 12× basal; P < 0.05). CONCLUSION: The higher frequency of GCM2 282D in PHPT and enhanced transcriptional activity of this variant supports the notion that it could contribute causally to parathyroid tumorigenesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,014

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,032
Tête enseignante GPT0,332
Écart entre enseignants0,300 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe Journal of Clinical Endocrinology & MetabolismMême sujetParathyroid Disorders and TreatmentsTravaux en français237 207