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Enregistrement W2127768831 · doi:10.1128/jb.183.20.5956-5963.2001

Type II Secretion by <i>Aeromonas salmonicida</i> : Evidence for Two Periplasmic Pools of Proaerolysin

2001· article· en· W2127768831 sur OpenAlexafffund
Sarah E. Burr, Dzung B. Diep, J. Thomas Buckley

Notice bibliographique

RevueJournal of Bacteriology · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueAquaculture disease management and microbiota
Établissements canadiensUniversity of Victoria
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésPeriplasmic spaceBiologySecretionBacterial outer membraneAeromonas salmonicidaImmunogold labellingOsmotic shockSecretory proteinCytoplasmBiochemistryVacuoleCell biologyMicrobiologyBacteriaUltrastructureEscherichia coliGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Aeromonas salmonicida containing the cloned gene for proaerolysin secretes the protein via the type II secretory pathway. Here we show that altering a region near the beginning of aerA led to a dramatic increase in the amount of proaerolysin that was produced and that a large amount of the protein was cell associated. All of the cell-associated protein had crossed the cytoplasmic membrane, because the signal sequence had been removed, and all of it was accessible to processing by trypsin during osmotic shock. Enlargement of the periplasm was observed by electron microscopy in overproducing cells, likely caused by the osmotic effect of the very large concentrations of accumulated proaerolysin. Immunogold electron microscopy localized nearly all of the proaerolysin in the enlarged periplasm; however, only half of the protoxin was released from the cells by osmotic shocking. Cross-linking studies showed that this fraction contained normal dimeric proaerolysin but that proaerolysin in the fraction that was not shockable had not dimerized, although it appeared to be correctly folded. Both periplasmic fractions were secreted by the cells; however, the nonshockable fraction was secreted much more slowly than the shockable fraction. We estimated a rate for maximal secretion of proaerolysin from the bacteria that was much lower than the rates that have been estimated for inner membrane transit, which suggests that transit across the outer membrane is rate limiting and may account for the periplasmic accumulation of the protein. Finally, we show that overproduction of proaerolysin inhibited the release of the protease that is secreted by A. salmonicida.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,284
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2001
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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