MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2127786744

Quantification of MUCIN 1, cell surface associated and MUCIN16, cell surface associated proteins in tears and conjunctival epithelial cells collected from postmenopausal women.

2013· article· en· W2127786744 sur OpenAlexaff
Sruthi Srinivasan, Miriam Heynen, Elizabeth Martell, Robert Ritter, Lyndon Jones, Michelle Senchyna

Notice bibliographique

RevuePubMed · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueOcular Surface and Contact Lens
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMucinMUC1TearsMessenger RNACellProtein expressionBiologyGene expressionPostmenopausal womenChemistryCell biologyImmunologyEndocrinologyGeneBiochemistry
DOInon disponible

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: To quantify the expression of mucin 1, cell surface associated (MUC1) and mucin 16, cell surface associated (MUC16) proteins and messenger ribonucleic acid (mRNA) in a cohort of postmenopausal women (PMW), to explore the relationship between mucin expression, dry eye symptomology, and tear stability. METHODS: Thirty-nine healthy PMW (>50 years of age) were enrolled in this study. No specific inclusion criteria were used to define dry eye; instead, a range of subjects were recruited based on responses to the Allergan Ocular Surface Disease Index (OSDI) questionnaire and tear stability measurements as assessed by non-invasive tear breakup time (NITBUT). Tears were collected from the inferior tear meniscus using a disposable glass capillary tube, and total RNA and total protein were isolated from conjunctival epithelial cells collected via impression cytology. Expression of membrane-bound and soluble MUC1 and MUC16 were quantified with western blotting, and expression of MUC1 and MUC16 mRNA was assessed with real-time PCR. RESULTS: OSDI responses ranged from 0 to 60, and NITBUT ranged from 18.5 to 2.9 s. Only two statistically significant correlations were found: soluble MUC16 protein concentration and MUC16 mRNA expression with OSDI vision related (-0.47; p=0.01) and ocular symptom (0.39; p=0.02) subscores, respectively. Post hoc exploratory analysis on absolute expression values was performed on two subsets of subjects defined as asymptomatic (OSDI≤6, n=12) and moderate to severe symptomatic (OSDI≥20, n=12). The only significant difference between the two subgroups was a significant reduction in MUC16 mRNA expression found in the symptomatic dry eye group (1.52±1.19 versus 0.57±0.44; p=0.03). CONCLUSIONS: A broad exploration of mucin expression compared to either a sign (NITBUT) or symptoms of dry eye failed to reveal compelling evidence supporting a significant relationship, other than a potential association between MUC16 with specific symptoms. Furthermore, comparison of mucin protein and expression levels between the asymptomatic and moderate to severe symptomatic subgroups revealed only one significant difference, a reduction in MUC16 mRNA expression in the symptomatic subgroup.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,191
Écart entre enseignants0,182 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePubMedMême sujetOcular Surface and Contact LensTravaux en français237 207