Evidence that homozygous PTPRD gene microdeletion causes trigonocephaly, hearing loss, and intellectual disability
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: The premature fusion of metopic sutures results in the clinical phenotype of trigonocephaly. An association of this characteristic with the monosomy 9p syndrome is well established and the receptor-type protein tyrosine phosphatase gene (PTPRD), located in the 9p24.1p23 region and encoding a major component of the excitatory and inhibitory synaptic organization, is considered as a good candidate to be responsible for this form of craniosynostosis. Moreover PTPRD is known to recruit multiple postsynaptic partners such as IL1RAPL1 which gene alterations lead to non syndromic intellectual disability (ID). RESULTS: We describe a 30 month old boy with severe intellectual disability, trigonocephaly and dysmorphic facial features such as a midface hypoplasia, a flat nose, a depressed nasal bridge, hypertelorism, a long philtrum and a drooping mouth. Microarray chromosomal analysis revealed the presence of a homozygous deletion involving the PTPRD gene, located on chromosome 9p22.3. Reverse Transcription PCR (RT-PCR) amplifications all along the gene failed to amplify the patient's cDNA in fibroblasts, indicating the presence of two null PTPRD alleles. Synaptic PTPRD interacts with IL1RAPL1 which defects have been associated with intellectual disability (ID) and autism spectrum disorder. The absence of the PTPRD transcript leads to a decrease in the expression of IL1RAPL1. These results suggest the direct involvement of PTPRD in ID, which is consistent with the PTPRD -/- mice phenotype. Deletions of PTPRD have been previously suggested as a cause of trigonocephaly in patients with monosomy 9p and genome-wide association study suggested variations in PTPRD are associated with hearing loss. CONCLUSIONS: The deletion identified in the reported patient supports previous hypotheses on its function in ID and hearing loss. However, its involvement in the occurrence of metopic synostosis is still to be discussed as more investigation of patients with the 9p monosomy syndrome is required.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».