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Enregistrement W2127840878 · doi:10.1093/ndt/gfv087

Genome-wide studies to identify risk factors for kidney disease with a focus on patients with diabetes

2015· review· en· W2127840878 sur OpenAlexaff
Florina Regele, Kíra Jelencsics, Dov Shiffman, Guillaume Paré, Matthew McQueen, Johannes F.E. Mann, Rainer Oberbauer

Notice bibliographique

RevueNephrology Dialysis Transplantation · 2015
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueChronic Kidney Disease and Diabetes
Établissements canadiensHamilton Health SciencesMcMaster UniversityPopulation Health Research Institute
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGenome-wide association studyMedicineKidney diseaseAlbuminuriaDiseaseGenetic associationSingle-nucleotide polymorphismPopulationBioinformaticsDiabetic nephropathyGeneticsDiabetes mellitusInternal medicineBiologyEndocrinologyGenotypeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Chronic kidney disease (CKD) affects 10-13% of the general population and diabetic nephropathy (DN) is the leading cause of end-stage renal disease (ESRD). In addition to known demographic, biochemical and lifestyle risk factors, genetics is also contributing to CKD risk. In recent years, genome-wide association studies (GWAS) have provided a hypothesis-free approach to identify common genetic variants that could account for the genetic risk component of common diseases such as CKD. The identification of these variants might reveal the biological processes underlying renal impairment and could aid in improving risk estimates for CKD. This review aims to describe the methods as well as strengths and limitations of GWAS in CKD and to summarize the findings of recent GWAS in DN. Several loci and SNPs have been found to be associated with distinct CKD traits such as eGFR and albuminuria. For diabetic kidney disease, several loci were identified in different populations. Subsequent functional studies provided insights into the mechanism of action of some of these variants, such as UMOD or CERS2. However, overall, the results were ambiguous, and a few of the variants were not consistently replicated. In addition, the slow progression from albuminuria to ESRD could limit the power of longitudinal studies. The typically small effect size associated with genetic variants as well as the small portion of the variability of the phenotype explained by these variants limits the utility of genetic variants in improving risk prediction. Nevertheless, identifying these variants could give a deeper understanding of the molecular pathways underlying CKD, which in turn, could potentially lead to the development of new diagnostic and therapeutic tools.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,481
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,318
Écart entre enseignants0,290 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations50
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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