Genetic architecture of quantitative trait loci associated with morphological and agronomic trait differences in a wild by cultivated barley cross
Notice bibliographique
Résumé
Hordeum vulgare subsp. spontaneum is the progenitor of cultivated barley (Hordeum vulgare L.). Domestication combined with plant breeding has led to the morphological and agronomic characteristics of modern barley cultivars. The objective of this study was to map the genetic factors that morphologically and agronomically differentiate wild barley from modern barley cultivars. To address this objective, we identified quantitative trait loci (QTLs) associated with plant height, flag leaf width, spike length, spike width, glume length in relation to seed length, awn length, fragility of ear rachis, endosperm width and groove depth, heading date, flag leaf length, number of tillers per plant, and kernel color in a Harrington/OUH602 advanced backcross (BC2F8) population. This population was genotyped with 113 simple sequence repeat markers. Thirty QTLs were identified, of which 16 were newly identified in this study. One to 4 QTLs were identified for each of the traits except glume length, for which no QTL was detected. The portion of phenotypic variation accounted for by individual QTLs ranged from about 9% to 54%. For traits with more than one QTL, the phenotypic variation explained ranged from 25% to 71%. Taken together, our results reveal the genetic architecture of morphological and agronomic traits that differentiate wild from cultivated barley.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».