Non-uniform Velocity of Homogeneous DNA in a Uniform Electric Field: Consequence of Electric-Field-Induced Slow Dissociation of Highly Stable DNA–Counterion Complexes
Notice bibliographique
Résumé
Identical molecules move with identical velocities when placed in a uniform electric field within a uniform electrolyte. Here we report that homogeneous DNA does not obey this fundamental rule. While most DNA moves with similar velocities, a fraction of DNA moves with velocities that vary within a multiple-fold range. The size of this irregular fraction increases several orders of magnitude when exogenous counterions are added to DNA. The irregular fraction decreases several orders of magnitude when DNA counterions are removed by dialysis against deionized water in the presence of a strong electric field (0.6 kV/cm). Dialysis without the field is ineffective in decreasing the size of irregular fraction. These results suggest that (i) DNA can form very stable complexes with counterions, (ii) these complexes can be dissociated by an electric field, and (iii) the observed non-uniform velocity of DNA is caused by electric-field-induced slow dissociation of these stable complexes. Our findings help to better understand a fundamental property of DNA: its interaction with counterions. In addition, these findings suggest a practical way of making electromigration of DNA more uniform: removal of strongly bound DNA counterions by electro-dialysis against deionized water.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».