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Enregistrement W2128083719 · doi:10.1093/neuonc/nor207

An in vivo patient-derived model of endogenous IDH1-mutant glioma

2011· article· en· W2128083719 sur OpenAlexaff
H. Artee Luchman, O. D. Stechishin, Nam H. Dang, Michael Blough, C. Chesnelong, John J. Kelly, Shaun A. Nguyen, Jennifer A. Chan, Aalim M. Weljie, J. G. Cairncross, Sarah A. Weiss

Notice bibliographique

RevueNeuro-Oncology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGlioma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensHotchkiss Brain InstituteUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésIsocitrate dehydrogenaseGliomaCancer researchEndogenyCell cultureIDH1BiologyMutationIn vivoMutantBiochemistryGeneticsEnzymeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Somatic mutations in the catalytic domain of isocitrate dehydrogenase (IDH) 1/2 and accumulation of the oncometabolite 2-hydroxyglutarate (2-HG) appear to be among the earliest events in gliomagenesis and may contribute to malignant transformation. The lack of cell lines with endogenous mutations has been one of the major challenges in studying IDH1/2-mutant glioma and developing novel therapeutics for these tumors. Here, we describe the isolation of a glioma brain tumor stem cell line (BT142) with an endogenous R132H mutation in IDH1, aggressive tumor-initiating capacity, and 2-HG production. The neurosphere culture method was used to establish a brain tumor stem cell line from an IDH1-mutant anaplastic oligoastrocytoma sample, and an orthotopic xenograft system was developed to allow its rapid expansion. Production of 2-HG by glioma cells with endogenous IDH1 mutations was confirmed by mass spectrometry. BT142 retained an endogenous R132H IDH1 mutation in culture and possessed aggressive tumor-initiating capacity, allowing it to be readily propagated in orthotopic xenografts of nonobese diabetic/severe combined immune deficiency (NOD SCID) mice. Endogenous 2-HG production by BT142 was detectable in both cell culture medium and xenograft animal serum. BT142 is the first brain tumor cell line with an endogenous IDH1 mutation and detectable 2-HG production both in vitro and in vivo, which thus provides a unique model for studying the biology of IDH1-mutant glioma and in vivo validation of compounds targeting IDH1-mutant cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Étiquettes directes de modèles (non validées)

Étiquettes de catégorie et de devis d'étude par modèle, issues des rondes d'étiquetage. C'est une sortie machine, non validée, et le désaccord entre modèles est livré comme donnée. Aucun devis ici n'est encore validé contre MEDLINE.

BrasCatégoriesDevis d'étudeConfiance
gemmaaucune catégorie
Domaine: non disponible · Genre: Empirique
Porte sur le système de recherche canadien: non · Porte sur un sujet canadien: non
Expérimental (laboratoire)low
gptaucune catégorie
Domaine: non disponible · Genre: Empirique
Porte sur le système de recherche canadien: non · Porte sur un sujet canadien: non
Expérimental (laboratoire)low
modèles en accordL'accord compare des ensembles de catégories et des devis identiques entre les bras.

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,060
Tête enseignante GPT0,282
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Étiqueté directement par 2 modèles lisant le dossier complet.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations205
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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