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Enregistrement W2128172210 · doi:10.1002/hed.21817

Comparing ERCC1 protein expression, mRNA levels, and genotype in squamous cell carcinomas of the head and neck treated with concurrent chemoradiation stratified by HPV status

2011· article· en· W2128172210 sur OpenAlexaff
Desirée Hao, Harold Lau, Misha Eliasziw, Alan Box, Román Diaz, Alexander C. Klimowicz, Brian Shin, Susan P. Lees‐Miller, Anthony M. Magliocco

Notice bibliographique

RevueHead & Neck · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA Repair Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of CalgaryAlberta Health Services
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésERCC1GenotypeMedicineHead and neck squamous-cell carcinomaOncologyHead and neck cancerHazard ratioMessenger RNAInternal medicineCellHead and neckAntibodyCancer researchPathologyNucleotide excision repairBiologyCancerGeneConfidence intervalImmunologyDNA repairSurgery

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Previous studies examining excision repair cross-complementation group 1 (ERCC1) in squamous cell carcinoma of the head and neck (SCCHN) have not compared methods of ERCC1 testing nor been stratified by human papillomavirus (HPV) status. METHODS: ERCC1 protein expression, mRNA, and genotype were retrospectively evaluated from pretreatment biopsies in 55 patients with SCCHN treated with chemoradiation. RESULTS: In all, 50% of patients had high ERCC1 protein expression, 28.2% had low mRNA levels, and genotype frequencies were C/C = 17.1%, C/T = 43.9%, and T/T = 39.0%. No correlations were found among protein expression, mRNA, or genotype. With a median follow-up of 54 months, the 5-year overall survival was 57.7%. After adjusting for known prognostic factors, ERCC1 protein level and genotype resulted in hazard ratios indicating an increased risk of death of 4.4-fold (p = .004) and 4.2-fold (p = .044), respectively. An exploratory analysis suggested a differential prognostic effect in HPV-negative SCCHN. CONCLUSIONS: ERCC1 protein expression using the FL297 antibody warrants further study as a potential prognostic marker in SCCHN.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,080
Score d'incertitude au seuil0,474

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,231
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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