Submicroscopic deletions of 11q24-25 in individuals without Jacobsen syndrome: re-examination of the critical region by high-resolution array-CGH
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Jacobsen syndrome is a rare contiguous gene disorder that results from a terminal deletion of the long arm of chromosome 11. It is typically characterized by intellectual disability, a variety of physical anomalies and a distinctive facial appearance. The 11q deletion has traditionally been identified by routine chromosome analysis. Array-based comparative genomic hybridization (array-CGH) has offered new opportunities to identify and refine chromosomal abnormalities in regions known to be associated with clinical syndromes. RESULTS: Using the 1 Mb BAC array (Spectral Genomics), we screened 70 chromosomally normal children with idiopathic intellectual disability (ID) and congenital abnormalities, and identified five cases with submicroscopic abnormalities believed to contribute to their phenotypes. Here, we provide detailed molecular cytogenetic descriptions and clinical presentation of two unrelated subjects with de novo submicroscopic deletions within chromosome bands 11q24-25. In subject 1 the chromosome rearrangement consisted of a 6.18 Mb deletion (from 128.25-134.43 Mb) and an adjacent 5.04 Mb duplication (from 123.15-128.19 Mb), while in subject 2, a 4.74 Mb interstitial deletion was found (from 124.29-129.03 Mb). Higher resolution array analysis (385 K Nimblegen) was used to refine all breakpoints. Deletions of the 11q24-25 region are known to be associated with Jacobsen syndrome (JBS: OMIM 147791). However, neither of the subjects had the typical features of JBS (trigonocephaly, platelet disorder, heart abnormalities). Both subjects had ID, dysmorphic features and additional phenotypic abnormalities: subject 1 had a kidney abnormality, bilateral preauricular pits, pectus excavatum, mild to moderate conductive hearing loss and behavioral concerns; subject 2 had macrocephaly, an abnormal MRI with delayed myelination, fifth finger shortening and squaring of all fingertips, and sensorineural hearing loss. CONCLUSION: Two individuals with ID who did not have the typical clinical features of Jacobsen syndrome were found to have deletions within the JBS region at 11q24-25. Their rearrangements facilitate the refinement of the JBS critical region and suggest that a) deletion of at least 3 of the 4 platelet function critical genes (ETS-1, FLI-1 and NFRKB and JAM3) is necessary for thrombocytopenia; b) one of the critical regions for heart abnormalities (conotruncal heart defects) may lie within 129.03 - 130.6 Mb; c) deletions of KCNJ1 and ADAMTS15 may contribute to the renal anomalies in Jacobsen Syndrome; d) the critical region for MRI abnormalities involves a region from 124.6 - 129.03 Mb. Our results reiterate the benefits of array-CGH for description of new phenotype/genotype associations and refinement of previously established ones.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».