Mimicking the Biomolecular Control of Calcium Oxalate Monohydrate Crystal Growth: Effect of Contiguous Glutamic Acids
Notice bibliographique
Résumé
Scanning confocal interference microscopy (SCIM) and molecular dynamics (MD) simulations were used to investigate the adsorption of the synthetic polypeptide poly(l-glutamic acid) (poly-glu) to calcium oxalate monohydrate (COM) crystals and its effect on COM formation. At low concentrations (1 μg/mL), poly-glu inhibits growth most effectively in ⟨001⟩ directions, indicating strong interactions of the polypeptide with {121} crystal faces. Growth in <010> directions was inhibited only marginally by 1 μg/mL poly-glu, while growth in <100> directions did not appear to be affected. This suggests that, at low concentrations, poly-glu inhibits lattice-ion addition to the faces of COM in the order {121} > {010} ≥ {100}. At high concentrations (6 μg/mL), poly-glu resulted in the formation of dumbbell-shaped crystals featuring concave troughs on the {100} faces. The effects on crystal growth indicate that, at high concentrations, poly-glu interacts with the faces of COM in the order {100} > {121} > {010}. This mirrors MD simulations, which predicted that poly-glu will adsorb to a {100} terrace plane (most calcium-rich) in preference to a {121} (oblique) riser plane but will adsorb to {121} riser plane in preference to an {010} terrace plane (least calcium-rich). The effects of different poly-glu concentration on COM growth (1-6 μg/mL) may be due to variations between the faces in terms of growth mechanism and/or (nano)roughness, which can affect surface energy. In addition, 1 μg/mL might not be adequate to reach the critical concentration for poly-glu to significantly pin step movement on {100} and {010} faces. Understanding the mechanisms involved in these processes is essential for the development of agents to reduce recurrence of kidney stone disease.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».