Large-Scale Data Integration Reveals Colocalization of Gene Functional Groups with Meta-QTL for Multiple Disease Resistance in Barley
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Race-nonspecific and durable resistance of plant genotypes to major pathogens is highly relevant for yield stability and sustainable crop production but difficult to handle in practice due to its polygenic inheritance by quantitative trait loci (QTL). As far as the underlying genes are concerned, very little is currently known in the most important crop plants such as the cereals. Here, we integrated publicly available data for barley (Hordeum vulgare subsp. vulgare) in order to detect the most important genomic regions for QTL-mediated resistance to a number of fungal pathogens and localize specific functional groups of genes within these regions. This identified 20 meta-QTL, including eight hot spots for resistance to multiple diseases that were distributed over all chromosomes. At least one meta-QTL region for resistance to the powdery mildew fungus Blumeria graminis was found to be co-linear between barley and wheat, suggesting partial evolutionary conservation. Large-scale genetic mapping revealed that functional groups of barley genes involved in secretory processes and cell-wall reinforcement were significantly over-represented within QTL for resistance to powdery mildew. Overall, the results demonstrate added value resulting from large-scale genetic and genomic data integration and may inform genomic-selection procedures for race-nonspecific and durable disease resistance in barley.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle