Resequencing of 29 Candidate Genes in Patients With Familial and Sporadic Amyotrophic Lateral Sclerosis
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVE: To identify novel disease-causing genes for amyotrophic lateral sclerosis (ALS). DESIGN, SETTING, AND PATIENTS: We carried out a systematic mutation screening of the entire coding regions of 29 candidate genes encoding critically important proteins for proper differentiation and development of corticospinal motor neurons in 190 patients with familial and sporadic ALS. MAIN OUTCOME MEASURES: We focused our analysis on coding variants and evaluated the distribution of nonsynonymous and synonymous variants in our cohort of patients with ALS. RESULTS: We identified 40 novel nonsynonymous variants and showed a significant excess of unique nonsynonymous variants in our cohort of patients with ALS, which suggests the presence of ALS-predisposing mutations. CONCLUSIONS: Using a multifaceted approach based on the functional prediction of missense variants, the conservation of the altered amino acid, and the cosegregation of the variants identified in familial cases, we identified several promising novel genes for ALS such as LUM and CRYM. We have also highlighted the analytical challenges of large-scale sequencing screens to detect disease-causing variants.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».