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Enregistrement W2128397518 · doi:10.1093/hmg/10.21.2341

Oligomerization of polyalanine expanded PABPN1 facilitates nuclear protein aggregation that is associated with cell death

2001· article· en· W2128397518 sur OpenAlexaff
Xueping Fan

Notice bibliographique

RevueHuman Molecular Genetics · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueGenetic Neurodegenerative Diseases
Établissements canadiensMcGill UniversityMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésOculopharyngeal muscular dystrophyBiologyProtein aggregationNuclear proteinProgrammed cell deathPoly(A)-binding proteinRNACellCell biologyGeneMolecular biologyRNA-binding proteinBiochemistryGeneticsMuscular dystrophyTranscription factorApoptosis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Oculopharyngeal muscular dystrophy (OPMD) is an adult-onset disorder characterized by progressive eyelid drooping, swallowing difficulties and proximal limb weakness. The autosomal dominant form of this disease is caused by short expansions of a (GCG)(6) repeat to (GCG)(8-13) in the PABPN1 gene, which results in the expansion of a polyalanine stretch from 10 to 12-17 alanines in the N-terminus of the protein. Mutated PABPN1 (mPABPN1) is able to induce nuclear protein aggregation and form filamentous nuclear inclusions, which are the pathological hallmarks of OPMD. PABPN1, when bound to poly(A) RNA, forms both linear filaments and discrete-sized, compact oligomeric particles in vitro. In the absence of poly(A) RNA, PABPN1 can form oligomers. Here we report that: (i) oligomerization of PABPN1 is mediated by two potential oligomerization domains (ODs); (ii) inactivating oligomerization of mPABPN1 by deletions of 6-8 amino acids in either of the ODs prevents nuclear protein aggregation; (iii) expression of mPABPN1 in COS-7 cells is associated with cell death; and (iv) preventing nuclear protein aggregation by inactivating oligomerization of mPABPN1 significantly reduces cell death. These findings suggest that oligomerization of PABPN1 plays a crucial role in the formation of OPMD nuclear protein aggregation, while the expanded polyalanine stretch is necessary but not sufficient to induce OPMD protein aggregation, and that the nuclear protein aggregation might be toxic and cause cell death. These observations also imply that inactivation of oligomerization of mPABPN1 might be a useful therapeutic strategy for OPMD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,017
Score d'incertitude au seuil0,971

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations113
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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