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Enregistrement W2128434644 · doi:10.1128/aem.02297-09

Type II Diacylglycerol Acyltransferase from<i>Claviceps purpurea</i>with Ricinoleic Acid, a Hydroxyl Fatty Acid of Industrial Importance, as Preferred Substrate

2009· article· en· W2128434644 sur OpenAlexaff
Ioannis Mavraganis, Dauenpen Meesapyodsuk, Patricia Vrinten, Mark Smith, Xiao Qiu

Notice bibliographique

RevueApplied and Environmental Microbiology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLipid metabolism and biosynthesis
Établissements canadiensPlant Biotechnology InstituteUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRicinoleic acidClaviceps purpureaBiochemistryBiologyLinoleic acidFatty acidOleic acidThioesteraseAcyltransferaseBiosynthesisEnzymeCastor oil

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Claviceps purpurea, the fungal pathogen that causes the cereal disease ergot, produces glycerides that contain high levels of ricinoleic acid [(R)-12-hydroxyoctadec-cis-9-enoic acid] in its sclerotia. Recently, a fatty acid hydroxylase (C. purpurea FAH [CpFAH]) involved in the biosynthesis of ricinoleic acid was identified from this fungus (D. Meesapyodsuk and X. Qiu, Plant Physiol. 147:1325-1333, 2008). Here, we describe the cloning and biochemical characterization of a C. purpurea type II diacylglycerol acyltransferase (CpDGAT2) involved in the assembly of ricinoleic acid into triglycerides. The CpDGAT2 gene was cloned by degenerate RT-PCR (reverse transcription-PCR). The expression of this gene restored the in vivo synthesis of triacylglycerol (TAG) in the quadruple mutant strain Saccharomyces cerevisiae H1246, in which all four TAG biosynthesis genes (DGA1, LRO1, ARE1, and ARE2) are disrupted. In vitro enzymatic assays using microsomal preparations from the transformed yeast strain indicated that CpDGAT2 prefers ricinoleic acid as an acyl donor over linoleic acid, oleic acid, or linolenic acid, and it prefers 1,2-dioleoyl-sn-glycerol over 1,2-dipalmitoyl-sn-glycerol as an acyl acceptor. The coexpression of CpFAH with CpDGAT2 in yeast resulted in an increased accumulation of ricinoleic acid compared to the coexpression of CpFAH with the native yeast DGAT2 (S. cerevisiae DGA1 [ScDGA1]) or the expression of CpFAH alone. Northern blot analysis indicated that CpFAH is expressed solely in sclerotium cells, with no transcripts of this gene being detected in mycelium or conidial cells. CpDGAT2 was more widely expressed among the cell types examined, although expression was low in conidiospores. The high expression of CpDGAT2 and CpFAH in sclerotium cells, where high levels of ricinoleate glycerides accumulate, provided further evidence supporting the roles of CpDGAT2 and CpFAH as key enzymes for the synthesis and assembly of ricinoleic acid in C. purpurea.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,181
Écart entre enseignants0,174 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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