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Enregistrement W2128488659 · doi:10.1242/jcs.092262

Chronic hypoxia compromises repair of DNA double-strand breaks to drive genetic instability

2012· article· en· W2128488659 sur OpenAlexaff
Ramya Kumareswaran, Olga Ludkovski, Alice Meng, Jenna Sykes, Melania Pintilie, Robert G. Bristow

Notice bibliographique

RevueJournal of Cell Science · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA Repair Mechanisms
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyDNA damageDNA repairMolecular biologyDNAGenome instabilityChromosome instabilityHomologous recombinationClonogenic assayCancer researchGeneticsCell cultureGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Hypoxic cells have been linked to genetic instability and tumor progression. However, little is known about the exact relationship between DNA repair and genetic instability in hypoxic cells. We therefore tested whether the sensing and repair of DNA double-strand breaks (DNA-dsbs) is altered in irradiated cells kept under continual oxic, hypoxic or anoxic conditions. Synchronized G0-G1 human fibroblasts were irradiated (0-10 Gy) after initial gassing with 0% O(2) (anoxia), 0.2% O(2) (hypoxia) or 21% O(2) (oxia) for 16 hours. The response of phosphorylated histone H2AX (γ-H2AX), phosphorylated ataxia telangiectasia mutated [ATM(Ser1981)], and the p53 binding protein 1 (53BP1) was quantified by intranuclear DNA repair foci and western blotting. At 24 hours following DNA damage, residual γ-H2AX, ATM(Ser1981) and 53BP1 foci were observed in hypoxic cells. This increase in residual DNA-dsbs under hypoxic conditions was confirmed using neutral comet assays. Clonogenic survival was also reduced in chronically hypoxic cells, which is consistent with the observation of elevated G1-associated residual DNA-dsbs. We also observed an increase in the frequency of chromosomal aberrations in chronically hypoxic cells. We conclude that DNA repair under continued hypoxia leads to decreased repair of G1-associated DNA-dsbs, resulting in increased chromosomal instability. Our findings suggest that aberrant DNA-dsb repair under hypoxia is a potential factor in hypoxia-mediated genetic instability.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations133
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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