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Enregistrement W2128628371 · doi:10.1093/hmg/11.2.185

Prevalence of HFE gene C282Y and H63D mutations in a French-Canadian population of neonates and in referred patients

2002· article· en· W2128628371 sur OpenAlexafffundabout
Julie Girouard

Notice bibliographique

RevueHuman Molecular Genetics · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueIron Metabolism and Disorders
Établissements canadiensHôpital Saint-François d'Assise
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNorthwestern University
Mots-clésCompound heterozygosityGenotypeHereditary hemochromatosisBiologyAllelePopulationGeneticsHemochromatosisAllele frequencyGeneMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Hereditary hemochromatosis is a genetic disease characterized by exaggerated absorption of intestinal iron leading to its accumulation in some organs over the years. Its prevalence is estimated to be 3-5/1000 in Caucasians. A single mutation, C282Y in the HFE gene explains 80-90% of all diagnosed cases in populations of northwestern European ancestry. The importance of another frequent mutation in this gene, H63D, as well as of C282Y/H63D compound heterozygotes, is still a matter of debate. We estimated the prevalence of these mutations in newborns from a genetically well defined French-Canadian population, in Quebec City. We compared genotype and allele frequencies between neonates and referred patients for HFE molecular analysis. We genotyped anonymous-unlinked cord blood samples for C282Y (n = 881) and H63D (n = 870) mutations from neonates. Referred patients (n = 1084) were genotyped in two different laboratories and pooled after verifying the similarity of both groups. No C282Y homozygote was found in neonates (allele frequency = 0.043). However, we identified 163 C282Y homozygotes (15%) among 1084 referred patients leading to a, not surprising, 97-fold enrichment of this genotype. We found a similar proportion of genotypes homozygous for H63D in both groups suggesting a weak association with the disease. However, we found a 5-fold enrichment of compound heterozygotes in the referred group. Fewer C282Y homozygotes were observed in the French-Canadian population than in northwest Europe populations. However, the strong enrichment of homozygotes between the neonates and the referred patients is an argument in favour of screening for this lethal disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,920

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,243
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2002
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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