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Enregistrement W2128808414 · doi:10.1074/jbc.m406411200

Preapoptotic Chromatin Condensation Upstream of the Mitochondrial Checkpoint

2004· article· en· W2128808414 sur OpenAlexfundno aff
Karine Andréau, Maria Castedo, Jean‐Luc Perfettini, Thomas Roumier, Evelyne Pichart, Sylvie Souquère, Sonia Vivet, Nathanaël Larochette, Guido Kroemer

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCell death mechanisms and regulation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesEuropean CommissionImmunoGenSidactionMcMaster UniversityStyrelsen för Internationellt Utvecklingssamarbete
Mots-clésChromatinStaurosporineCell biologyApoptosisDNA fragmentationProphaseBiologyCytochrome cDNA damageCaspaseMolecular biologyMitochondrionDNAProgrammed cell deathChemistryKinaseBiochemistryProtein kinase A

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

When added for a short period (2-4 h) to cells, the kinase inhibitor staurosporine (STS), can trigger double strand breaks, the formation of nuclear foci containing phosphorylated H2AX, Chk2, and p53, a decrease in transcription, and a minor degree of peripheral chromatin condensation. This "preapoptotic chromatin condensation" (PACC) occurs before mitochondrial membrane permeabilization (MMP) and caspase activation become detectable and is not inhibited by Z-VAD-fmk or Bcl-2. PACC is followed by classical apoptosis, when cells are cultured overnight, even when STS is removed from the system. After overnight incubation, STS-pretreated cells manifest mitochondrial cytochrome c release, caspase activation, phosphatidylserine exposure, and apoptotic DNA fragmentation. Caspase or MMP inhibitors did not influence the advent of PACC yet did suppress the evolution of PACC toward apoptosis. Importantly, two unrelated MMP inhibitors (viral mitochondrial inhibitor of apoptosis (vMIA) from cytomegalovirus and mitochondrion-targeted Bcl-2) had a larger range of effects than the pan-caspase inhibitor Z-VAD-fmk. Caspase inhibition simply prevented the transition from PACC to apoptosis yet did not reverse PACC and did not restore transcription. In contrast, Bcl-2 and vMIA allowed for the repair of the DNA lesions, correlating with the reestablishment of active transcription. PACC could also be induced by a gross perturbation of RNA synthesis or primary DNA damage. Again, inhibition of MMP (but not that of caspases) reversed PACC induced by these stimuli. In synthesis, our data reveal the unexpected capacity of STS to induce DNA lesions and suggest qualitative differences in the cytoprotective and DNA repair-inducing potential of different apoptosis inhibitors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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