Haplotype analysis of human <i>AMPD1</i> gene: origin of common mutant allele
Notice bibliographique
Résumé
yoadenylate deaminase is a skeletal muscle specific isoenzyme of AMP deaminase (AMPD; EC 3.5.4.6) that plays an important role in regulating adenylate energy charge and nucleotide metabolism.An inherited defect of this enzyme has been reported to be due to a single mutant allele with two linked mutations of C34T (exon 2, Q12X) and C143T (exon 3, P48L) of the AMPD1 gene in almost all cases. 1 2 Further, a previous report showed a very high frequency (10214%) of the C34T allele in whites and African Americans, 2 although it has not been found in a Japanese population.Although most individuals with homozygous C34T alleles are assumed to be asymptomatic, some have been reported to show a relatively mild clinical phenotype including exercise induced myalgia. 1 Recently, additional findings for missense mutations were reported in Japanese (R388W and R425H) 3 and in whites (G468T) 4 who showed muscle weakness and myalgia.Therefore, the relationship between abnormal purine nucleotide catabolism and skeletal muscle dysfunction 4 is intriguing.In addition, other studies have reported that the C34T allele correlates with improved clinical outcome in patients with heart disease.5 6 We speculated that reduced AMPD activity in skeletal muscle would increase the production of the cardioprotection molecule, adenosine, resulting in increased levels of adenosine in the circulating system, although the fundamental mechanisms responsible for the disorder due to AMPD mutations are unclear.In the present study, we attempted to determine other AMPD1 mutations and their distribution in ethnically diverse population groups, in order to better understand AMPD1 deficiency and its functional relevance.We identified 35 variations in and around the AMPD1 locus, including newly identified missense mutations.By estimating SNP haplotypes and defining typical haplotypes of the AMPD1 locus, we were also able to describe a phylogenic tree for ancestral AMPD1 haplotypes responsible for the most common variant, C34T.Furthermore, we identified two new mutant alleles, A860T (K287I) and G930T (M310I), in German myopathic patients and revealed their enzymatic defect.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
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Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».