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Enregistrement W2128844407 · doi:10.1136/jmg.2003.013151

Haplotype analysis of human <i>AMPD1</i> gene: origin of common mutant allele

2004· letter· en· W2128844407 sur OpenAlexfundno aff
Keiko Toyama

Notice bibliographique

RevueJournal of Medical Genetics · 2004
Typeletter
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA modifications and cancer
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of GeneticsRIKENUniversity of TokyoGout Research Foundation of JapanMinistry of Health, Labour and WelfareMinistry of Education, Culture, Sports, Science and Technology
Mots-clésAMP deaminaseBiologyGeneticsAllelePopulationSkeletal muscleAllele frequencyMissense mutationAdenosine deaminaseInternal medicineMutationEndocrinologyAdenosineGeneMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

yoadenylate deaminase is a skeletal muscle specific isoenzyme of AMP deaminase (AMPD; EC 3.5.4.6) that plays an important role in regulating adenylate energy charge and nucleotide metabolism. An inherited defect of this enzyme has been reported to be due to a single mutant allele with two linked mutations of C34T (exon 2, Q12X) and C143T (exon 3, P48L) of the AMPD1 gene in almost all cases. 1 2 Further, a previous report showed a very high frequency (10214%) of the C34T allele in whites and African Americans, 2 although it has not been found in a Japanese population. Although most individuals with homozygous C34T alleles are assumed to be asymptomatic, some have been reported to show a relatively mild clinical phenotype including exercise induced myalgia. 1 Recently, additional findings for missense mutations were reported in Japanese (R388W and R425H) 3 and in whites (G468T) 4 who showed muscle weakness and myalgia. Therefore, the relationship between abnormal purine nucleotide catabolism and skeletal muscle dysfunction 4 is intriguing. In addition, other studies have reported that the C34T allele correlates with improved clinical outcome in patients with heart disease. 5 6 We speculated that reduced AMPD activity in skeletal muscle would increase the production of the cardioprotection molecule, adenosine, resulting in increased levels of adenosine in the circulating system, although the fundamental mechanisms responsible for the disorder due to AMPD mutations are unclear.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,245
Score d'incertitude au seuil0,797

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,319
Écart entre enseignants0,296 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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