MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2128907894 · doi:10.1086/605931

Impaired Interferon‐γ Responses, Increased Interleukin‐17 Expression, and a Tumor Necrosis Factor–α Transcriptional Program in Invasive Aspergillosis

2009· article· en· W2128907894 sur OpenAlexaff
Darius Armstrong‐James, Suzy A. Turnbull, Ian Teo, Jaroslav Stark, Nicola J. Rogers, Thomas R. Rogers, Elaine Bignell, Ken Haynes

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Infectious Diseases · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntifungal resistance and susceptibility
Établissements canadiensSt. Thomas Hospital
Organismes subventionnairesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilMedical Research CouncilCGD Research Trust
Mots-clésImmunologyAspergillosisNeutropeniaCalcineurinImmunityTumor necrosis factor alphaBiologyInterferonInterleukinInterferon gammaCytokineImmune systemMedicineTransplantationInternal medicineChemotherapy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Invasive aspergillosis (IA) is the most common cause of death associated with fungal infection in the developed world. Historically, susceptibility to IA has been associated with prolonged neutropenia; however, IA has now become a major problem in patients on calcineurin inhibitors and allogenic hematopoietic stem cell transplant patients following engraftment. These observations suggest complex cellular mechanisms govern immunity to IA. METHODS: To characterize the key early events that govern outcome from infection with Aspergillus fumigatus, we performed a comparative immunochip microarray analysis of the pulmonary transcriptional response to IA between cyclophosphamide-treated mice and immunocompetent mice at 24 h after infection. RESULTS: We demonstrate that death due to infection is associated with a failure to generate an incremental interferon-gamma response, increased levels of interleukin-5 and interleukin-17a transcript, coordinated expression of a network of tumor necrosis factor-alpha-related genes, and increased levels of tumor necrosis factor-alpha. In contrast, clearance of infection is associated with increased expression of a number genes encoding proteins involved in innate pathogen clearance, as well as apoptosis and control of inflammation. CONCLUSION: This first organ-level immune response transcriptional analysis for IA has enabled us to gain new insights into the mechanisms that govern fungal immunity in the lung.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,281
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations33
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe Journal of Infectious DiseasesMême sujetAntifungal resistance and susceptibilityTravaux en français237 207